More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3361 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  100 
 
 		 629 aa  1244    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  56.01 
 
 		 651 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  53.63 
 
 		 667 aa  611  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  51.13 
 
 		 656 aa  608  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  54.32 
 
 		 642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  51.1 
 
 		 628 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  50.54 
 
 		 629 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  50.79 
 
 		 616 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  51.68 
 
 		 658 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  51.17 
 
 		 634 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  49 
 
 		 644 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  51.46 
 
 		 645 aa  582  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  48.73 
 
 		 656 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  50.55 
 
 		 623 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.84 
 
 		 636 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  49.22 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  51.9 
 
 		 652 aa  558  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  48.9 
 
 		 624 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  48.8 
 
 		 629 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  48.98 
 
 		 629 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  45.6 
 
 		 641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  48.9 
 
 		 616 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  48.51 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  45.69 
 
 		 648 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  47.31 
 
 		 627 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  46.32 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  46.48 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  46.62 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  46.48 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  45.62 
 
 		 649 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  44.06 
 
 		 639 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  44.79 
 
 		 639 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  45.61 
 
 		 647 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  47.48 
 
 		 628 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  44.53 
 
 		 932 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  37.85 
 
 		 699 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  41.09 
 
 		 718 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  52.09 
 
 		 700 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.83 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.36 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.78 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.56 
 
 		 604 aa  267  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.83 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.25 
 
 		 618 aa  263  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  38.44 
 
 		 626 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.26 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.24 
 
 		 656 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  39.06 
 
 		 599 aa  256  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.07 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.21 
 
 		 595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.71 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.09 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  25.84 
 
 		 626 aa  251  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  34.75 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.66 
 
 		 587 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.35 
 
 		 614 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.3 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.09 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.15 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.44 
 
 		 663 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  28.67 
 
 		 571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.68 
 
 		 660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.07 
 
 		 592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  29.08 
 
 		 601 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37 
 
 		 587 aa  243  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  31.31 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  28.71 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.7 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  28.62 
 
 		 600 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  27.61 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.07 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  32.27 
 
 		 674 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.78 
 
 		 660 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37 
 
 		 664 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  36.46 
 
 		 637 aa  240  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.47 
 
 		 613 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.5 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  33.47 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  37.96 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.21 
 
 		 638 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.4 
 
 		 655 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.89 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  41.98 
 
 		 576 aa  239  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.5 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  30.72 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  34.58 
 
 		 655 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.5 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.03 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  27.46 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  27.46 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  36.75 
 
 		 592 aa  237  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.66 
 
 		 585 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.43 
 
 		 653 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.31 
 
 		 660 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.11 
 
 		 663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>