More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1947 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  100 
 
 
932 aa  1900    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  49.56 
 
 
629 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  49.03 
 
 
616 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  44.91 
 
 
656 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  47.61 
 
 
629 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  45.96 
 
 
651 aa  492  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  47.35 
 
 
624 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  49.65 
 
 
616 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  50.18 
 
 
632 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  47.19 
 
 
628 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  45.21 
 
 
656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  46.09 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  46.48 
 
 
634 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  49.38 
 
 
627 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  48.73 
 
 
645 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  44.98 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  44.96 
 
 
667 aa  465  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  44.85 
 
 
644 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  43.68 
 
 
639 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  43.61 
 
 
642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  46.04 
 
 
636 aa  455  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  44.52 
 
 
623 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  48.78 
 
 
628 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  43.63 
 
 
658 aa  442  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  46.74 
 
 
629 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  44.46 
 
 
649 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  43.15 
 
 
641 aa  436  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  46.27 
 
 
655 aa  436  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  44.28 
 
 
647 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  42.69 
 
 
648 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  43.94 
 
 
639 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  44.96 
 
 
652 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  43.94 
 
 
640 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  43.94 
 
 
640 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  43.94 
 
 
640 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  35.69 
 
 
718 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  51.95 
 
 
700 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  37.54 
 
 
699 aa  386  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  31.18 
 
 
626 aa  221  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.74 
 
 
599 aa  221  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.79 
 
 
600 aa  220  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.68 
 
 
595 aa  218  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.39 
 
 
587 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  26.43 
 
 
626 aa  210  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.25 
 
 
618 aa  210  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.6 
 
 
583 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.57 
 
 
588 aa  207  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  35.21 
 
 
655 aa  206  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.46 
 
 
582 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.15 
 
 
590 aa  205  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  28.42 
 
 
598 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  28.83 
 
 
598 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.37 
 
 
604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.48 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  28.25 
 
 
598 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  28.25 
 
 
598 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  30.62 
 
 
590 aa  200  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  28.25 
 
 
598 aa  200  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  28.25 
 
 
598 aa  200  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  28.25 
 
 
598 aa  200  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.4 
 
 
694 aa  200  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  28.42 
 
 
598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  28.42 
 
 
598 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  31.58 
 
 
604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.75 
 
 
605 aa  199  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.91 
 
 
587 aa  199  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  29.98 
 
 
571 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.88 
 
 
601 aa  198  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  28.1 
 
 
600 aa  197  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.26 
 
 
660 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.52 
 
 
660 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  30.81 
 
 
601 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  32.86 
 
 
587 aa  197  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.26 
 
 
660 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  29.98 
 
 
588 aa  196  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  30.44 
 
 
632 aa  195  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  31.77 
 
 
652 aa  195  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.01 
 
 
660 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.44 
 
 
663 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  37.14 
 
 
588 aa  194  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  34.78 
 
 
642 aa  194  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  35.06 
 
 
599 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  37.06 
 
 
647 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  31.02 
 
 
598 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.94 
 
 
664 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.08 
 
 
613 aa  191  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  31.33 
 
 
617 aa  191  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  32.7 
 
 
564 aa  190  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.41 
 
 
652 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.82 
 
 
584 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  31.3 
 
 
666 aa  188  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  37 
 
 
641 aa  188  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  31.45 
 
 
613 aa  187  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.84 
 
 
651 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  32.24 
 
 
655 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  30.33 
 
 
601 aa  187  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  28.24 
 
 
578 aa  187  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  36.77 
 
 
576 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  34.52 
 
 
580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.25 
 
 
593 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>