More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1675 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  54.4 
 
 		 624 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  56.02 
 
 		 657 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  58.9 
 
 		 629 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  58.11 
 
 		 645 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  58.12 
 
 		 627 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  59 
 
 		 616 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  54.33 
 
 		 641 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  55.25 
 
 		 639 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  59.08 
 
 		 632 aa  691    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  55.79 
 
 		 616 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  100 
 
 		 628 aa  1267    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  57.08 
 
 		 629 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  54.57 
 
 		 649 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  55.4 
 
 		 629 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  52.31 
 
 		 656 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  55.38 
 
 		 655 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  52.82 
 
 		 639 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  53.19 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  50.91 
 
 		 656 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  52.2 
 
 		 634 aa  595  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  52.41 
 
 		 667 aa  598  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  51.52 
 
 		 623 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  53.26 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  53.42 
 
 		 640 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  53.42 
 
 		 640 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  51.38 
 
 		 651 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  51.33 
 
 		 628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  49.62 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  49.92 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  47.6 
 
 		 658 aa  561  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  50.15 
 
 		 636 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  49.46 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  58.15 
 
 		 700 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  47.09 
 
 		 629 aa  505  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  46.56 
 
 		 652 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  47.73 
 
 		 932 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  37.32 
 
 		 718 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  37.48 
 
 		 699 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.88 
 
 		 600 aa  296  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.4 
 
 		 587 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.06 
 
 		 588 aa  286  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.55 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.44 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.95 
 
 		 599 aa  280  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  39.96 
 
 		 626 aa  277  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35 
 
 		 583 aa  276  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.79 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  39.45 
 
 		 618 aa  274  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.55 
 
 		 626 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.37 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.16 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.16 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.11 
 
 		 663 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.11 
 
 		 664 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.62 
 
 		 638 aa  264  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.49 
 
 		 604 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.74 
 
 		 613 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.94 
 
 		 584 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.41 
 
 		 666 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  38.95 
 
 		 642 aa  263  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  30.99 
 
 		 590 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.86 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.09 
 
 		 595 aa  261  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.5 
 
 		 619 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.35 
 
 		 601 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.67 
 
 		 655 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.97 
 
 		 614 aa  257  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.82 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  31.81 
 
 		 593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  30 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.69 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.21 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  33.33 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.04 
 
 		 595 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  29.66 
 
 		 539 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  35.69 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.25 
 
 		 605 aa  253  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.32 
 
 		 651 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.57 
 
 		 592 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.79 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.62 
 
 		 676 aa  251  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  34.02 
 
 		 567 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  37.98 
 
 		 660 aa  251  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  32.37 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.65 
 
 		 652 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.87 
 
 		 582 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  34.54 
 
 		 694 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.27 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  33.94 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.27 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  33.94 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  33.94 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.27 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.27 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>