More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0806 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  58.3 
 
 		 629 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  53.35 
 
 		 639 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  54.5 
 
 		 656 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  53 
 
 		 629 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  57.58 
 
 		 645 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  53.65 
 
 		 657 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  53.7 
 
 		 616 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  100 
 
 		 655 aa  1287    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  54.14 
 
 		 632 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  50.54 
 
 		 623 aa  621  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  52.28 
 
 		 641 aa  621  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  54.29 
 
 		 627 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  53 
 
 		 616 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  55.69 
 
 		 628 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  51.68 
 
 		 667 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  52.13 
 
 		 639 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  51.61 
 
 		 624 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  53.38 
 
 		 628 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  52.11 
 
 		 649 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  53.15 
 
 		 636 aa  591  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  53.08 
 
 		 644 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  52.27 
 
 		 647 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  49.85 
 
 		 634 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  51.81 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  51.81 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  51.66 
 
 		 640 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  50.52 
 
 		 629 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  50.76 
 
 		 648 aa  572  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  50.52 
 
 		 656 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  50.67 
 
 		 651 aa  571  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  48.43 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  50.78 
 
 		 652 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  47.38 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  46.47 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  45.42 
 
 		 932 aa  452  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  42.6 
 
 		 699 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  49.23 
 
 		 718 aa  438  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.36 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41.06 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.41 
 
 		 587 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.63 
 
 		 626 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  41.42 
 
 		 626 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.57 
 
 		 600 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  39.24 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  40.26 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.51 
 
 		 595 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.67 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.46 
 
 		 582 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.54 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  38.3 
 
 		 655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.95 
 
 		 599 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38 
 
 		 584 aa  270  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  41.28 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.43 
 
 		 619 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.96 
 
 		 605 aa  266  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  31.95 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  33.8 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  40.63 
 
 		 599 aa  262  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.7 
 
 		 601 aa  261  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.58 
 
 		 694 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  33.57 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.96 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.42 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.69 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.66 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  33.65 
 
 		 642 aa  257  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  27.06 
 
 		 640 aa  254  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.92 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.72 
 
 		 664 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.22 
 
 		 663 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  33.81 
 
 		 539 aa  253  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.39 
 
 		 585 aa  253  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  32.04 
 
 		 590 aa  253  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.33 
 
 		 655 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.39 
 
 		 588 aa  253  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.65 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  37.7 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.47 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  30.79 
 
 		 590 aa  251  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  33.92 
 
 		 666 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.7 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.79 
 
 		 660 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  37.85 
 
 		 647 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 604 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  34.09 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.65 
 
 		 652 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  32.78 
 
 		 703 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.48 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.48 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.57 
 
 		 598 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.27 
 
 		 617 aa  248  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.57 
 
 		 598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.65 
 
 		 651 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>