More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07990 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  100 
 
 		 642 aa  1311    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  58.39 
 
 		 626 aa  723    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  49.44 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  45.07 
 
 		 655 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  40.62 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.28 
 
 		 663 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.31 
 
 		 581 aa  283  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.53 
 
 		 616 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.11 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.11 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.05 
 
 		 664 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  38.06 
 
 		 652 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.91 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.17 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  35.17 
 
 		 636 aa  275  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.24 
 
 		 604 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  36.18 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  36.18 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  36.18 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.8 
 
 		 582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  36.63 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  34.91 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  34.91 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  34.91 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  34.91 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.81 
 
 		 605 aa  273  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.04 
 
 		 645 aa  273  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.12 
 
 		 599 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  36.98 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  39.21 
 
 		 623 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  38.17 
 
 		 667 aa  272  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  39.06 
 
 		 700 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.88 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  34.71 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.94 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.69 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  37.5 
 
 		 656 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  32.59 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  35.14 
 
 		 616 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.84 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.16 
 
 		 613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  37.33 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.91 
 
 		 584 aa  267  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.74 
 
 		 598 aa  267  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.71 
 
 		 594 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.29 
 
 		 588 aa  266  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.26 
 
 		 604 aa  266  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.33 
 
 		 663 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.36 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.76 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  39.16 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  31.15 
 
 		 584 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.65 
 
 		 651 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.72 
 
 		 598 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  33.33 
 
 		 624 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.72 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.15 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.83 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.56 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  37.39 
 
 		 657 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.49 
 
 		 571 aa  261  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  32.49 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  36.1 
 
 		 629 aa  260  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  33.86 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.74 
 
 		 660 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  36.18 
 
 		 584 aa  260  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.74 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  34.57 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.61 
 
 		 587 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  35.79 
 
 		 599 aa  259  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.03 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  33.09 
 
 		 638 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  38.12 
 
 		 655 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  38.92 
 
 		 588 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  35.02 
 
 		 699 aa  257  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  32.64 
 
 		 586 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  32.57 
 
 		 600 aa  256  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  36.02 
 
 		 578 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  34.53 
 
 		 574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.65 
 
 		 595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  35.92 
 
 		 641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.41 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.98 
 
 		 686 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  37.73 
 
 		 631 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.17 
 
 		 694 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  35.75 
 
 		 576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  31.99 
 
 		 595 aa  254  5.000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  32.01 
 
 		 639 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.46 
 
 		 584 aa  253  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>