More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0720 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  96.92 
 
 
617 aa  1047    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  97.53 
 
 
647 aa  1085    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  100 
 
 
647 aa  1266    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  73.56 
 
 
607 aa  813    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  47.79 
 
 
454 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  45.78 
 
 
452 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  39.4 
 
 
583 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.33 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  43.51 
 
 
605 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.16 
 
 
604 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.73 
 
 
588 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  40.26 
 
 
571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.9 
 
 
600 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  40.62 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  40.36 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.16 
 
 
604 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  40.62 
 
 
598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  46.65 
 
 
619 aa  287  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.32 
 
 
626 aa  286  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.74 
 
 
587 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.25 
 
 
613 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  41.06 
 
 
601 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  41.32 
 
 
587 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.6 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.24 
 
 
599 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.97 
 
 
598 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  37.82 
 
 
629 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  33.84 
 
 
632 aa  273  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.78 
 
 
613 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.69 
 
 
593 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  40.04 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  34.33 
 
 
577 aa  270  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.92 
 
 
660 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.95 
 
 
676 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.61 
 
 
605 aa  267  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  38.56 
 
 
577 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.63 
 
 
579 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  35.37 
 
 
636 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.62 
 
 
578 aa  264  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  39.37 
 
 
582 aa  264  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.5 
 
 
614 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.38 
 
 
660 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  43.13 
 
 
639 aa  263  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  41.56 
 
 
576 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.71 
 
 
652 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.4 
 
 
653 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  38.43 
 
 
636 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.03 
 
 
600 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.47 
 
 
604 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  42.55 
 
 
611 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.41 
 
 
544 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.77 
 
 
640 aa  261  4e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  37.39 
 
 
638 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  41.02 
 
 
580 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  33.47 
 
 
704 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  37.67 
 
 
625 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  37.67 
 
 
625 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  37.7 
 
 
622 aa  260  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  37.72 
 
 
800 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  37.7 
 
 
622 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.84 
 
 
601 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.83 
 
 
656 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.3 
 
 
617 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  36.53 
 
 
571 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  43.48 
 
 
606 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.68 
 
 
588 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.89 
 
 
599 aa  258  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  39.78 
 
 
572 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  43.98 
 
 
655 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  36.86 
 
 
641 aa  257  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.09 
 
 
657 aa  257  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.84 
 
 
595 aa  257  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  37.14 
 
 
630 aa  257  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  39.6 
 
 
642 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  40.21 
 
 
603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.1 
 
 
595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  40.21 
 
 
603 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  35.94 
 
 
640 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.1 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.02 
 
 
584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  40.3 
 
 
645 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  38.52 
 
 
627 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  38.24 
 
 
623 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  33.26 
 
 
674 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  37.58 
 
 
622 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  37.82 
 
 
679 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  36.29 
 
 
604 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  38.46 
 
 
669 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.17 
 
 
684 aa  253  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  38.15 
 
 
624 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  38.15 
 
 
624 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  37.42 
 
 
641 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  38.15 
 
 
624 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  38.15 
 
 
624 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  38.15 
 
 
624 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>