More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3453 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  59.56 
 
 
657 aa  731    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  100 
 
 
640 aa  1297    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  78.38 
 
 
639 aa  997    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  99.69 
 
 
640 aa  1293    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  87.85 
 
 
647 aa  1097    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  65.73 
 
 
639 aa  820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  59.81 
 
 
629 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  63.21 
 
 
641 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  99.69 
 
 
640 aa  1293    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  88.18 
 
 
649 aa  1125    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  51.8 
 
 
629 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  52.43 
 
 
632 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  49.3 
 
 
634 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  53.42 
 
 
628 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  51.69 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  49.69 
 
 
624 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  51.72 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  48.04 
 
 
648 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  48.27 
 
 
616 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  50.83 
 
 
655 aa  555  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  48.63 
 
 
651 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  46.89 
 
 
667 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  48.06 
 
 
629 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  46.79 
 
 
656 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  46.69 
 
 
623 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  48.4 
 
 
642 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  45.95 
 
 
658 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  46.79 
 
 
628 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  45.13 
 
 
656 aa  513  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  45.89 
 
 
636 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  47.81 
 
 
616 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  45.99 
 
 
644 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  45.29 
 
 
629 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.24 
 
 
652 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  38.29 
 
 
699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  38.4 
 
 
718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  51.88 
 
 
700 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  43.94 
 
 
932 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.97 
 
 
583 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  38.93 
 
 
588 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.63 
 
 
582 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.07 
 
 
626 aa  263  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.2 
 
 
600 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.38 
 
 
587 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.65 
 
 
588 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.08 
 
 
619 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.23 
 
 
587 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  40.46 
 
 
605 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  41.41 
 
 
647 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.53 
 
 
584 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38 
 
 
618 aa  247  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.4 
 
 
599 aa  247  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  41.41 
 
 
647 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.51 
 
 
605 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  34.81 
 
 
655 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  32.65 
 
 
704 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.34 
 
 
578 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.48 
 
 
600 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  36.14 
 
 
626 aa  236  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  35.56 
 
 
587 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.27 
 
 
652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  33.18 
 
 
632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 
604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.07 
 
 
581 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  29.66 
 
 
653 aa  234  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.71 
 
 
598 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.71 
 
 
598 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.71 
 
 
598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.71 
 
 
598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.49 
 
 
604 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.71 
 
 
598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.71 
 
 
571 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  36.64 
 
 
641 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.46 
 
 
581 aa  233  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.49 
 
 
595 aa  233  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.01 
 
 
598 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  32.14 
 
 
662 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  32.96 
 
 
656 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  32.88 
 
 
581 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  30.77 
 
 
601 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  40.87 
 
 
617 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.26 
 
 
598 aa  230  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.26 
 
 
598 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.32 
 
 
601 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  34.92 
 
 
640 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  29.52 
 
 
657 aa  229  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  32.68 
 
 
581 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  32.68 
 
 
581 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  31.47 
 
 
582 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  31.47 
 
 
582 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  33.79 
 
 
633 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  32.68 
 
 
581 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  31.47 
 
 
582 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  32.68 
 
 
581 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.49 
 
 
590 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>