More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1292 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  51.86 
 
 		 675 aa  747    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  55.31 
 
 		 640 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  57.04 
 
 		 686 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  57.8 
 
 		 682 aa  773    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  46.49 
 
 		 677 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  100 
 
 		 694 aa  1414    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  46.73 
 
 		 678 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  50.56 
 
 		 625 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  58.4 
 
 		 684 aa  792    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  46.04 
 
 		 677 aa  682    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  46.19 
 
 		 677 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  57.89 
 
 		 690 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  55.93 
 
 		 679 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  51.71 
 
 		 646 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  51.71 
 
 		 646 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  49.38 
 
 		 675 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  51.7 
 
 		 636 aa  608  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  53.3 
 
 		 634 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.93 
 
 		 595 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  40.1 
 
 		 599 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.86 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.21 
 
 		 605 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.88 
 
 		 598 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.44 
 
 		 613 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.99 
 
 		 601 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.62 
 
 		 626 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.12 
 
 		 604 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.7 
 
 		 600 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.48 
 
 		 587 aa  290  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  41.67 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.1 
 
 		 614 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.65 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  37.47 
 
 		 616 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.34 
 
 		 676 aa  283  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.25 
 
 		 574 aa  282  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.5 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.49 
 
 		 587 aa  281  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.28 
 
 		 600 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  41.08 
 
 		 613 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.52 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.52 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  37.47 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.52 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.52 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.52 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.52 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.49 
 
 		 674 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  32.98 
 
 		 653 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.95 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.25 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.03 
 
 		 652 aa  277  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.74 
 
 		 633 aa  277  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.19 
 
 		 656 aa  277  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.63 
 
 		 651 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.25 
 
 		 598 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  39.24 
 
 		 571 aa  276  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.83 
 
 		 582 aa  276  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.16 
 
 		 663 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  42.41 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.07 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  37.29 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.67 
 
 		 652 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  40.24 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.56 
 
 		 703 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.34 
 
 		 664 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.01 
 
 		 584 aa  274  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.34 
 
 		 583 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  274  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.38 
 
 		 584 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  44.48 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  35.91 
 
 		 623 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  44.86 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39.3 
 
 		 662 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.26 
 
 		 582 aa  272  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.74 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  37.05 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  37.05 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  39.91 
 
 		 622 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  44.41 
 
 		 660 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.8 
 
 		 584 aa  272  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.5 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  44.76 
 
 		 660 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.93 
 
 		 605 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.19 
 
 		 673 aa  271  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.53 
 
 		 655 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  38.57 
 
 		 583 aa  271  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  40.39 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  35.88 
 
 		 606 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  40.39 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  38.13 
 
 		 581 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  38.13 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  38.13 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  38.13 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>