More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1522 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  54.14 
 
 		 658 aa  689    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  100 
 
 		 634 aa  1280    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  68.2 
 
 		 656 aa  870    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  53.3 
 
 		 636 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  63.24 
 
 		 642 aa  773    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  61.02 
 
 		 667 aa  755    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  55.66 
 
 		 628 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  53.66 
 
 		 644 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  63.9 
 
 		 651 aa  809    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  50.16 
 
 		 656 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  49.77 
 
 		 641 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  50.08 
 
 		 629 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  48.48 
 
 		 652 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  50.23 
 
 		 623 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  51.17 
 
 		 629 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  48.91 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  51.44 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  50.78 
 
 		 624 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  48.9 
 
 		 616 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  48.14 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  47.49 
 
 		 629 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  52.04 
 
 		 628 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  48.6 
 
 		 616 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  48.29 
 
 		 649 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  48.29 
 
 		 632 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  49.4 
 
 		 655 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  48.37 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  48.37 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  48.37 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  46.98 
 
 		 657 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  47.82 
 
 		 647 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  48.12 
 
 		 627 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  49.22 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  41.95 
 
 		 718 aa  515  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  42.18 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  45.13 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  55.9 
 
 		 700 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  45.97 
 
 		 932 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.36 
 
 		 588 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.5 
 
 		 583 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.95 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.36 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.74 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  30.08 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.86 
 
 		 595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.76 
 
 		 600 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.41 
 
 		 626 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.69 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.79 
 
 		 587 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  35.71 
 
 		 626 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.02 
 
 		 584 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  38.16 
 
 		 641 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.48 
 
 		 598 aa  259  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.33 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.46 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.44 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.78 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  32.28 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  32.28 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  31.3 
 
 		 653 aa  257  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  32.28 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  32.28 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  32.28 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34 
 
 		 598 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.07 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  41.18 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.49 
 
 		 660 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.08 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  30.61 
 
 		 599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.61 
 
 		 619 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  32.93 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.93 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  31.21 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  35.92 
 
 		 655 aa  253  9.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.14 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.13 
 
 		 632 aa  252  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.83 
 
 		 666 aa  252  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.16 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.09 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  28.55 
 
 		 590 aa  249  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  29.81 
 
 		 590 aa  250  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.1 
 
 		 660 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.96 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.96 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  35.7 
 
 		 647 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.84 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.84 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.84 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  29.48 
 
 		 588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.16 
 
 		 584 aa  247  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  36.31 
 
 		 682 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>