More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0326 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  100 
 
 		 539 aa  1085    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.03 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  37.53 
 
 		 662 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.05 
 
 		 605 aa  291  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.1 
 
 		 619 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.66 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  30.67 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  40.88 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.6 
 
 		 594 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  44.48 
 
 		 560 aa  286  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.73 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.97 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  36.74 
 
 		 653 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.81 
 
 		 587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.92 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  40.36 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.31 
 
 		 674 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.65 
 
 		 582 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.65 
 
 		 583 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.66 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.33 
 
 		 599 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.4 
 
 		 664 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.73 
 
 		 553 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.83 
 
 		 640 aa  279  8e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.62 
 
 		 601 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  42.37 
 
 		 535 aa  279  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.73 
 
 		 572 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.34 
 
 		 673 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.03 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  38.23 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  41.37 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.38 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  38.23 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.88 
 
 		 576 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40.83 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  38.83 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  38.72 
 
 		 576 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  36.56 
 
 		 586 aa  276  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.68 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.32 
 
 		 645 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.12 
 
 		 611 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.03 
 
 		 651 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.08 
 
 		 574 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.11 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.83 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  36.73 
 
 		 657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.68 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  39.59 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.25 
 
 		 601 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.34 
 
 		 703 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  35.96 
 
 		 601 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.34 
 
 		 584 aa  273  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  39.35 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.42 
 
 		 584 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.85 
 
 		 652 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  39.35 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  31.57 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  30.9 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.71 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  37.84 
 
 		 656 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  34.59 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  40.66 
 
 		 599 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.4 
 
 		 660 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.81 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.81 
 
 		 638 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  39.89 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  39.35 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.8 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  33.18 
 
 		 614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.66 
 
 		 604 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  38.22 
 
 		 660 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  30.56 
 
 		 616 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  38.74 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.11 
 
 		 663 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  37.31 
 
 		 586 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  34.79 
 
 		 636 aa  270  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.32 
 
 		 600 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  30.59 
 
 		 633 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  34.02 
 
 		 694 aa  269  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  33.4 
 
 		 605 aa  270  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  34.33 
 
 		 640 aa  269  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.11 
 
 		 660 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.03 
 
 		 660 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  38.81 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.98 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.9 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.47 
 
 		 660 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.39 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  30.49 
 
 		 686 aa  268  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.39 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.39 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  38.81 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  38.81 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.72 
 
 		 646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.72 
 
 		 646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  37.6 
 
 		 598 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.54 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  39.68 
 
 		 609 aa  267  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  38.38 
 
 		 582 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>