More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1910 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  100 
 
 
587 aa  1177    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  41.08 
 
 
587 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  40.43 
 
 
592 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  46.2 
 
 
595 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.24 
 
 
604 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.29 
 
 
605 aa  289  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.26 
 
 
614 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.97 
 
 
599 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  46.38 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  40.96 
 
 
651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  45.64 
 
 
655 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.02 
 
 
595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.57 
 
 
599 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.63 
 
 
600 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  45.8 
 
 
660 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.1 
 
 
604 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  40.45 
 
 
616 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  45.51 
 
 
660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  40.28 
 
 
544 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  45.8 
 
 
660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.32 
 
 
595 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  45.98 
 
 
638 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.06 
 
 
619 aa  278  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.85 
 
 
599 aa  277  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  45.11 
 
 
663 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  45.07 
 
 
573 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  45.59 
 
 
601 aa  276  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  40.64 
 
 
684 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  44.19 
 
 
651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  45.37 
 
 
575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  40.38 
 
 
629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  43.82 
 
 
652 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  44.25 
 
 
664 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  45.07 
 
 
576 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  40.39 
 
 
658 aa  273  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.41 
 
 
656 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  42.26 
 
 
593 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  40.3 
 
 
616 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  40.46 
 
 
629 aa  270  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.23 
 
 
600 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  43.53 
 
 
663 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.5 
 
 
571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  33.93 
 
 
613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  45.67 
 
 
575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.5 
 
 
598 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  42.65 
 
 
666 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  38.62 
 
 
588 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  44.48 
 
 
574 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  44.78 
 
 
574 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  40.26 
 
 
628 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  38.33 
 
 
656 aa  266  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  44.48 
 
 
574 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  41.67 
 
 
583 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.71 
 
 
645 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  44.48 
 
 
574 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  39.14 
 
 
677 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  38.41 
 
 
627 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  45.1 
 
 
574 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  38.17 
 
 
632 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  42.27 
 
 
686 aa  264  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.49 
 
 
626 aa  265  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  40.05 
 
 
574 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  45.1 
 
 
574 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  45.1 
 
 
574 aa  264  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.45 
 
 
645 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.89 
 
 
588 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.49 
 
 
574 aa  264  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  38.24 
 
 
623 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  46.29 
 
 
617 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.47 
 
 
582 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.03 
 
 
611 aa  263  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  37.88 
 
 
576 aa  263  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  41.12 
 
 
590 aa  262  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37 
 
 
613 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  44.81 
 
 
574 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.41 
 
 
578 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  42.27 
 
 
682 aa  262  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  41.51 
 
 
614 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  37.81 
 
 
636 aa  262  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.39 
 
 
656 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.04 
 
 
539 aa  261  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.53 
 
 
588 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  36.74 
 
 
609 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  40.17 
 
 
675 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  41.12 
 
 
590 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  42.9 
 
 
581 aa  259  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  39.35 
 
 
644 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.88 
 
 
601 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.56 
 
 
660 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  41.03 
 
 
679 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  40.21 
 
 
605 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.68 
 
 
598 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  39.24 
 
 
576 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>