More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2128 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  54.63 
 
 		 629 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  55.5 
 
 		 656 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  55.7 
 
 		 616 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  100 
 
 		 624 aa  1248    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  76.83 
 
 		 629 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  58.06 
 
 		 645 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  56.6 
 
 		 629 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  55.63 
 
 		 623 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  55.11 
 
 		 616 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  54.05 
 
 		 632 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  50.62 
 
 		 657 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  53.82 
 
 		 627 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  54.4 
 
 		 628 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  49.69 
 
 		 639 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  48.22 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  51.25 
 
 		 628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  48.91 
 
 		 639 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  49.93 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  50.54 
 
 		 655 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  50.78 
 
 		 634 aa  561  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  48.35 
 
 		 656 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  48.85 
 
 		 644 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  49.01 
 
 		 651 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.16 
 
 		 636 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  48.12 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  48.21 
 
 		 649 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  49.38 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  50.62 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  49.69 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  49.53 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  49.69 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  46.09 
 
 		 648 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  44.85 
 
 		 658 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  58.12 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  43.74 
 
 		 652 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  46.15 
 
 		 932 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  40.31 
 
 		 718 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  40.64 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.06 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.87 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  39.86 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  33.49 
 
 		 587 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.87 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.69 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.72 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.45 
 
 		 600 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.07 
 
 		 582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.65 
 
 		 598 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.56 
 
 		 571 aa  270  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.22 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.39 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.22 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.43 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.39 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.39 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.43 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.39 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.5 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.27 
 
 		 600 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.95 
 
 		 605 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.43 
 
 		 694 aa  262  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.1 
 
 		 613 aa  260  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.06 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.25 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.86 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  27.99 
 
 		 626 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.39 
 
 		 601 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.12 
 
 		 632 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  29.57 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  37.38 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.62 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.71 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  37.87 
 
 		 642 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.7 
 
 		 598 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.6 
 
 		 587 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 604 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.9 
 
 		 655 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.67 
 
 		 590 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  38.03 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.06 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.81 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.34 
 
 		 584 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.58 
 
 		 595 aa  250  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.52 
 
 		 636 aa  250  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  36.3 
 
 		 655 aa  249  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.76 
 
 		 664 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  32.43 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.69 
 
 		 663 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.97 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.04 
 
 		 656 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  32.5 
 
 		 652 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.1 
 
 		 592 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  38.13 
 
 		 666 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.15 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  33.63 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  29.82 
 
 		 604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.76 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  30.68 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.92 
 
 		 651 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.35 
 
 		 592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>