More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1261 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  100 
 
 		 588 aa  1136    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  40.62 
 
 		 642 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  30.3 
 
 		 593 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.76 
 
 		 645 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  37.56 
 
 		 626 aa  273  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  39.24 
 
 		 618 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  38.91 
 
 		 616 aa  269  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.79 
 
 		 600 aa  267  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  40.65 
 
 		 629 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  39.23 
 
 		 623 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  38.36 
 
 		 658 aa  263  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.71 
 
 		 613 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  35.81 
 
 		 616 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  39.4 
 
 		 651 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  38.82 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  36.95 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  37.76 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  39.39 
 
 		 583 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  39.48 
 
 		 613 aa  256  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  38.03 
 
 		 624 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  37.47 
 
 		 700 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  37.24 
 
 		 639 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.6 
 
 		 595 aa  253  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.42 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.42 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  37.62 
 
 		 632 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.42 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  39.27 
 
 		 667 aa  253  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  37.33 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  37.59 
 
 		 655 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  37.85 
 
 		 627 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  39.09 
 
 		 625 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.72 
 
 		 571 aa  250  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.93 
 
 		 601 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  36.26 
 
 		 657 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  29.18 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.08 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.28 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  38.82 
 
 		 629 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.79 
 
 		 595 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  36.62 
 
 		 629 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.75 
 
 		 587 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.1 
 
 		 619 aa  246  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  34.54 
 
 		 641 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.71 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.46 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.81 
 
 		 598 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  38.19 
 
 		 629 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  32.56 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  37.12 
 
 		 628 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  38.19 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.79 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.96 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.85 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  37.88 
 
 		 644 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  31.33 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  35.24 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  30.79 
 
 		 599 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  38.37 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.08 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.18 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.35 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  41.26 
 
 		 623 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  36.58 
 
 		 580 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.87 
 
 		 600 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.38 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.91 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.38 
 
 		 585 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.14 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  34.48 
 
 		 718 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  31.15 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.05 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.24 
 
 		 584 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  36.89 
 
 		 648 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  36.83 
 
 		 655 aa  240  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  29.47 
 
 		 539 aa  239  8e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.96 
 
 		 584 aa  239  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  31.1 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  30.98 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  31.1 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  38.84 
 
 		 641 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  31.1 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  30.98 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  31.1 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  29.86 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.4 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>