More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  100 
 
 		 652 aa  1305    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  50.99 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  48.9 
 
 		 656 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  49.32 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  50.23 
 
 		 658 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.54 
 
 		 636 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  49.62 
 
 		 628 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  49.85 
 
 		 651 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  49.09 
 
 		 634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  51.41 
 
 		 642 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  50.8 
 
 		 629 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  44.51 
 
 		 623 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  48 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  50.31 
 
 		 655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  60.05 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  44.73 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  45.66 
 
 		 641 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  45.09 
 
 		 656 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  45.59 
 
 		 616 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  46.58 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  42.45 
 
 		 718 aa  495  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  45.87 
 
 		 632 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  44.92 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  46.69 
 
 		 645 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  43.95 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  46.66 
 
 		 649 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  45.4 
 
 		 627 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  44.5 
 
 		 648 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  43.95 
 
 		 624 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  44.25 
 
 		 639 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  54.55 
 
 		 700 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  45.48 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  45.32 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  45.48 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  45.04 
 
 		 647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  46.71 
 
 		 628 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  42.68 
 
 		 629 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  43.62 
 
 		 932 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  39.6 
 
 		 618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  40.73 
 
 		 626 aa  301  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.37 
 
 		 626 aa  287  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  36.63 
 
 		 655 aa  274  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  38.06 
 
 		 642 aa  270  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.18 
 
 		 599 aa  267  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.8 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.24 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.43 
 
 		 595 aa  265  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.15 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.58 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.78 
 
 		 588 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.26 
 
 		 583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.04 
 
 		 582 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.21 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.77 
 
 		 585 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.63 
 
 		 587 aa  250  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.02 
 
 		 584 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  32.54 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.15 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.03 
 
 		 652 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.15 
 
 		 581 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.15 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37.59 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.15 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  29.87 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.07 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.05 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.87 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.56 
 
 		 663 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.05 
 
 		 651 aa  244  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.96 
 
 		 581 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.97 
 
 		 599 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.26 
 
 		 655 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.01 
 
 		 592 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  31.77 
 
 		 660 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  33.63 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.39 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.73 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.31 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.87 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  34.68 
 
 		 575 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  33.77 
 
 		 666 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.98 
 
 		 573 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.13 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.84 
 
 		 590 aa  239  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.56 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  35.95 
 
 		 583 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.83 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  30.65 
 
 		 652 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  30.38 
 
 		 604 aa  237  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.59 
 
 		 601 aa  237  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.05 
 
 		 613 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>