More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1932 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  100 
 
 		 648 aa  1305    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  53.11 
 
 		 629 aa  621  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  53.02 
 
 		 657 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  51.08 
 
 		 641 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  50.7 
 
 		 639 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  50.23 
 
 		 639 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  49.07 
 
 		 629 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  49.77 
 
 		 649 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  50 
 
 		 632 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  48.52 
 
 		 628 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  49.77 
 
 		 647 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  48.49 
 
 		 645 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  47.68 
 
 		 636 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  47.17 
 
 		 644 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  48.93 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  49.08 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  46.09 
 
 		 624 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  49.08 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  46.63 
 
 		 616 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  50 
 
 		 655 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  45.66 
 
 		 658 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  46.07 
 
 		 616 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  48.54 
 
 		 627 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  49.46 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  46.11 
 
 		 667 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  46.45 
 
 		 656 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  47.23 
 
 		 651 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  45.74 
 
 		 634 aa  502  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  45.88 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  45.32 
 
 		 656 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  47.47 
 
 		 629 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  45.69 
 
 		 629 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  45.71 
 
 		 642 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.05 
 
 		 652 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  52.93 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  40.8 
 
 		 699 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  40.53 
 
 		 718 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  43.36 
 
 		 932 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  39.23 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.48 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.52 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.46 
 
 		 599 aa  273  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.33 
 
 		 587 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.78 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  37.5 
 
 		 626 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.67 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.35 
 
 		 582 aa  260  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.57 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.81 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.83 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.91 
 
 		 601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.86 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.14 
 
 		 640 aa  250  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.79 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.47 
 
 		 605 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.55 
 
 		 605 aa  248  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.12 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  33.47 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.42 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  35.35 
 
 		 655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  36.53 
 
 		 642 aa  240  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.72 
 
 		 587 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.11 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  28.39 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.92 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  34.54 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  36.57 
 
 		 592 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.31 
 
 		 632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.81 
 
 		 617 aa  237  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  29.66 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  34.22 
 
 		 599 aa  236  7e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  29.37 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.81 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.47 
 
 		 660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.47 
 
 		 613 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  36.89 
 
 		 588 aa  234  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  31.45 
 
 		 666 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  35.71 
 
 		 647 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.21 
 
 		 638 aa  232  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.8 
 
 		 663 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  37.15 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.27 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.39 
 
 		 578 aa  231  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.99 
 
 		 664 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.82 
 
 		 590 aa  231  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.75 
 
 		 598 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.1 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.79 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  35.58 
 
 		 686 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  32.79 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.44 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  34.22 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>