More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2268 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  68.69 
 
 		 592 aa  807    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  100 
 
 		 587 aa  1175    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  41.08 
 
 		 587 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.07 
 
 		 599 aa  300  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.54 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  38.6 
 
 		 626 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.97 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  41.41 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  34.7 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  38.22 
 
 		 616 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.22 
 
 		 582 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  42.57 
 
 		 656 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.75 
 
 		 614 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  40.51 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.26 
 
 		 595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39 
 
 		 587 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.64 
 
 		 590 aa  274  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.82 
 
 		 588 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.94 
 
 		 600 aa  273  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  271  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  38.13 
 
 		 571 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  271  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  271  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  40.81 
 
 		 573 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  38.13 
 
 		 598 aa  270  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.85 
 
 		 656 aa  270  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  39.36 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  37.84 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  40.45 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  40 
 
 		 614 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  39 
 
 		 629 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.17 
 
 		 587 aa  266  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.13 
 
 		 605 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  39.62 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  36.89 
 
 		 651 aa  264  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  41.98 
 
 		 611 aa  263  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  37.1 
 
 		 645 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  38.31 
 
 		 564 aa  262  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.03 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  40.41 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  36.75 
 
 		 623 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  38.6 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  36.06 
 
 		 629 aa  259  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  42.67 
 
 		 642 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.91 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  37.97 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.06 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  38.68 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  37.72 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.9 
 
 		 599 aa  258  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  36.5 
 
 		 642 aa  258  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  43.46 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.74 
 
 		 601 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  39.51 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.37 
 
 		 655 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  38.42 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  36.98 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  37.01 
 
 		 656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.17 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  42.15 
 
 		 641 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  38.6 
 
 		 572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  38.96 
 
 		 544 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.81 
 
 		 652 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  38.6 
 
 		 553 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  38.6 
 
 		 624 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.14 
 
 		 651 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  34.2 
 
 		 699 aa  253  8.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  41.62 
 
 		 641 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  36.67 
 
 		 658 aa  253  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.76 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  41.29 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  39.19 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.38 
 
 		 660 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  38.42 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  42.47 
 
 		 582 aa  250  4e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.93 
 
 		 601 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.16 
 
 		 660 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  41.29 
 
 		 681 aa  250  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.47 
 
 		 584 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.33 
 
 		 604 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.12 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  44.26 
 
 		 627 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.77 
 
 		 663 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  36.66 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  34.84 
 
 		 616 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.18 
 
 		 613 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.56 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  31.49 
 
 		 598 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  36.47 
 
 		 634 aa  246  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.69 
 
 		 664 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  40.8 
 
 		 656 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.68 
 
 		 666 aa  246  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  38.57 
 
 		 599 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.1 
 
 		 638 aa  246  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  36.32 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>