More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  60.16 
 
 		 640 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  55.43 
 
 		 645 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  59.57 
 
 		 641 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  59.72 
 
 		 639 aa  748    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  55.93 
 
 		 628 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  54.17 
 
 		 629 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  59.72 
 
 		 639 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  60 
 
 		 640 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  59.72 
 
 		 647 aa  719    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  55.25 
 
 		 632 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  55.47 
 
 		 627 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  68.07 
 
 		 629 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  60 
 
 		 640 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  100 
 
 		 657 aa  1328    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  58.31 
 
 		 649 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  53.25 
 
 		 648 aa  628  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  51.96 
 
 		 616 aa  628  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  55.33 
 
 		 616 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  51.56 
 
 		 624 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  54.32 
 
 		 655 aa  611  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  50.52 
 
 		 667 aa  589  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  49.22 
 
 		 656 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  49.92 
 
 		 656 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  51.01 
 
 		 629 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  47.63 
 
 		 623 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  49.39 
 
 		 658 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  48.62 
 
 		 651 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  48.68 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  50.31 
 
 		 642 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  49.06 
 
 		 629 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  49.53 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  47.77 
 
 		 644 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  47.21 
 
 		 634 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.79 
 
 		 652 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  54.88 
 
 		 700 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  46.04 
 
 		 932 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  38.66 
 
 		 699 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  36.68 
 
 		 718 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  38.2 
 
 		 626 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  39.72 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.19 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.46 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.84 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.6 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.53 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.21 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.75 
 
 		 599 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.89 
 
 		 618 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.32 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.86 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  29.86 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.74 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.83 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.77 
 
 		 598 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.77 
 
 		 598 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.07 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.55 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.98 
 
 		 584 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.48 
 
 		 614 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  31.95 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  31.95 
 
 		 581 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  31.95 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  31.95 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  30.35 
 
 		 581 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.34 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.89 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.75 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.5 
 
 		 694 aa  251  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  31.79 
 
 		 581 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  37.39 
 
 		 642 aa  250  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  30.18 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.38 
 
 		 605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.96 
 
 		 663 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.94 
 
 		 617 aa  246  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.6 
 
 		 646 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.6 
 
 		 646 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  30.02 
 
 		 581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  30.02 
 
 		 581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.24 
 
 		 613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  33.55 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  32.47 
 
 		 539 aa  243  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  30.28 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.78 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  36.26 
 
 		 588 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.35 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  33.85 
 
 		 584 aa  242  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.52 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.56 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.26 
 
 		 584 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>