More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3785 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  100 
 
 
646 aa  1320    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  57.06 
 
 
640 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  58.97 
 
 
634 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  55.81 
 
 
690 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  54.83 
 
 
675 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  55.52 
 
 
636 aa  702    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  100 
 
 
646 aa  1320    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  52.22 
 
 
694 aa  634  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  49.81 
 
 
684 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  50.57 
 
 
686 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  49.12 
 
 
679 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  50 
 
 
682 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  49.33 
 
 
675 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  44.87 
 
 
677 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  44.68 
 
 
677 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  44.87 
 
 
677 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  44.68 
 
 
678 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  47.6 
 
 
625 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.31 
 
 
613 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  40.27 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.81 
 
 
595 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.86 
 
 
599 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.25 
 
 
601 aa  316  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.06 
 
 
605 aa  316  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.3 
 
 
587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.65 
 
 
599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.3 
 
 
600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.35 
 
 
604 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.19 
 
 
663 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.71 
 
 
664 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.96 
 
 
587 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.65 
 
 
651 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.79 
 
 
598 aa  296  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  42.31 
 
 
656 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.96 
 
 
660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.69 
 
 
614 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.19 
 
 
655 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  45.51 
 
 
660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.21 
 
 
599 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.08 
 
 
638 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.76 
 
 
583 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.85 
 
 
626 aa  293  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  45.22 
 
 
660 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.81 
 
 
582 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  42.54 
 
 
676 aa  292  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.23 
 
 
652 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  45.22 
 
 
660 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  42.54 
 
 
660 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.99 
 
 
588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.86 
 
 
619 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.08 
 
 
617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  43.18 
 
 
553 aa  285  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  44.68 
 
 
659 aa  285  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  39.04 
 
 
613 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  44.32 
 
 
663 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  42.9 
 
 
572 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  38.57 
 
 
677 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.06 
 
 
571 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.65 
 
 
652 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.68 
 
 
662 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.03 
 
 
600 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.25 
 
 
598 aa  279  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.95 
 
 
666 aa  279  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.09 
 
 
592 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  36.07 
 
 
651 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.32 
 
 
611 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.01 
 
 
598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  41.09 
 
 
584 aa  278  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.01 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.4 
 
 
604 aa  277  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.83 
 
 
596 aa  277  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.86 
 
 
655 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.64 
 
 
604 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  36.97 
 
 
571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  37.59 
 
 
640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  40.2 
 
 
601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.58 
 
 
632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.94 
 
 
703 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  40.05 
 
 
584 aa  275  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.55 
 
 
603 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  36.53 
 
 
603 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.99 
 
 
582 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  39.06 
 
 
598 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.51 
 
 
660 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.74 
 
 
590 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  41.18 
 
 
584 aa  272  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  41.64 
 
 
584 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.81 
 
 
598 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.95 
 
 
605 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  36.72 
 
 
674 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.34 
 
 
590 aa  270  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  35.7 
 
 
653 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  38.61 
 
 
581 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  38.61 
 
 
581 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  38.61 
 
 
581 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>