More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1681 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  68.69 
 
 		 587 aa  807    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  100 
 
 		 592 aa  1191    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.43 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  42.66 
 
 		 599 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.87 
 
 		 582 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.74 
 
 		 583 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.93 
 
 		 599 aa  276  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.87 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  37.68 
 
 		 616 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  41.71 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  41.1 
 
 		 656 aa  273  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.07 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.8 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.41 
 
 		 614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.91 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  37.37 
 
 		 564 aa  270  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.69 
 
 		 626 aa  269  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  41.19 
 
 		 580 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.99 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  38.5 
 
 		 623 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.18 
 
 		 645 aa  267  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.4 
 
 		 619 aa  266  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  33.22 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  42.08 
 
 		 655 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  36.17 
 
 		 651 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.72 
 
 		 614 aa  262  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.47 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.39 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  37.44 
 
 		 642 aa  261  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  42.78 
 
 		 605 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 604 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  41.07 
 
 		 642 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.48 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  38.16 
 
 		 667 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.01 
 
 		 595 aa  257  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  33.02 
 
 		 572 aa  257  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  41.38 
 
 		 573 aa  256  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.04 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  39.9 
 
 		 613 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  38.11 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.16 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  32.86 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  40.69 
 
 		 593 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  36.65 
 
 		 601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  30.1 
 
 		 554 aa  253  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  39.73 
 
 		 629 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  32.69 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  40.82 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  38.01 
 
 		 576 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.36 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.27 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  40.31 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  41.03 
 
 		 629 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  38.73 
 
 		 572 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.64 
 
 		 578 aa  250  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  38.73 
 
 		 616 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  37.81 
 
 		 577 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.79 
 
 		 656 aa  249  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  36.65 
 
 		 644 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.51 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  32.51 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  37.02 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  33.78 
 
 		 699 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  39.44 
 
 		 627 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.58 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  35.14 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  39.44 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.15 
 
 		 598 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  42.03 
 
 		 665 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  37.5 
 
 		 599 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  38.73 
 
 		 646 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.05 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  38.1 
 
 		 624 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.8 
 
 		 599 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  38.65 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.84 
 
 		 572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.11 
 
 		 613 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  40 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.44 
 
 		 660 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.06 
 
 		 646 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  32.34 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.06 
 
 		 646 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.59 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.07 
 
 		 576 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.02 
 
 		 638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.44 
 
 		 660 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  37.91 
 
 		 629 aa  243  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>