More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0761 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  56.09 
 
 		 616 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  67.52 
 
 		 656 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  100 
 
 		 623 aa  1269    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  56.72 
 
 		 645 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  57.87 
 
 		 629 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  55.63 
 
 		 624 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  50.84 
 
 		 651 aa  588  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  49.48 
 
 		 667 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  52.22 
 
 		 629 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  50.23 
 
 		 634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  49.47 
 
 		 656 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  49.36 
 
 		 628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  50.15 
 
 		 655 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  50.16 
 
 		 632 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  48.24 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50 
 
 		 629 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  48.08 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  48.29 
 
 		 636 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  49.2 
 
 		 627 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  49.52 
 
 		 616 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  46.87 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  51.52 
 
 		 628 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  46.74 
 
 		 658 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  46.97 
 
 		 642 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  46.08 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  46.13 
 
 		 649 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  45.91 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  44.33 
 
 		 652 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  46.91 
 
 		 647 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  46.69 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  46.69 
 
 		 640 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  46.69 
 
 		 640 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  43.37 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  57.34 
 
 		 700 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  45.66 
 
 		 648 aa  492  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  42.37 
 
 		 699 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  43.89 
 
 		 932 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  40.82 
 
 		 718 aa  429  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  39.05 
 
 		 583 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.58 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  30.36 
 
 		 626 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.07 
 
 		 587 aa  294  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.47 
 
 		 600 aa  293  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  42.23 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.7 
 
 		 599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.92 
 
 		 587 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  33.92 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  32.58 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.53 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.64 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  41.45 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.11 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.87 
 
 		 613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.66 
 
 		 590 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.38 
 
 		 581 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37 
 
 		 584 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.3 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.91 
 
 		 694 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  32.3 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.93 
 
 		 645 aa  272  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  31.95 
 
 		 586 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.07 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.16 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.16 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.05 
 
 		 582 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.53 
 
 		 655 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.36 
 
 		 598 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.5 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.5 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  35.29 
 
 		 544 aa  269  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.84 
 
 		 590 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.5 
 
 		 592 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  37.43 
 
 		 638 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.66 
 
 		 660 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  31.33 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.37 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.37 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.37 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.01 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.01 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.01 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.01 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  35.85 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.74 
 
 		 640 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.71 
 
 		 592 aa  264  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  31.69 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  39.21 
 
 		 642 aa  264  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  40.61 
 
 		 630 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>