More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2053 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  61.26 
 
 		 572 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  100 
 
 		 576 aa  1188    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  58.21 
 
 		 599 aa  690    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  54.13 
 
 		 580 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  47.22 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  45.74 
 
 		 567 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.4 
 
 		 640 aa  279  8e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.38 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.25 
 
 		 619 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.71 
 
 		 613 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.36 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  39.62 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.38 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  37.64 
 
 		 673 aa  264  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.66 
 
 		 584 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.91 
 
 		 599 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38.33 
 
 		 674 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.21 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.64 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.13 
 
 		 626 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.18 
 
 		 595 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.1 
 
 		 593 aa  259  9e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  32.58 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.29 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.57 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  34.29 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  39.89 
 
 		 665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.09 
 
 		 663 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  31.43 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.91 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  33.89 
 
 		 621 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.01 
 
 		 611 aa  253  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.1 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.28 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.56 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  30.67 
 
 		 645 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.01 
 
 		 592 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  31.76 
 
 		 604 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.95 
 
 		 639 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.24 
 
 		 663 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.27 
 
 		 655 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.3 
 
 		 664 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  33.93 
 
 		 587 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.46 
 
 		 703 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.8 
 
 		 638 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  35.81 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.11 
 
 		 587 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.02 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  36.79 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.61 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  30.62 
 
 		 655 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.06 
 
 		 662 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  39.1 
 
 		 669 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.99 
 
 		 660 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  31.22 
 
 		 599 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.69 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.11 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  35.03 
 
 		 601 aa  246  6e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.99 
 
 		 660 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.01 
 
 		 544 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  37.99 
 
 		 564 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  37.54 
 
 		 583 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.53 
 
 		 660 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.34 
 
 		 651 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.27 
 
 		 660 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  38.83 
 
 		 627 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  35.28 
 
 		 584 aa  246  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  39.28 
 
 		 629 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  38.56 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  35.85 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.82 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.08 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.82 
 
 		 574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  33.82 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.83 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.83 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.83 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.62 
 
 		 601 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 604 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.68 
 
 		 571 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  34.9 
 
 		 595 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  33.04 
 
 		 574 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  32.67 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>