More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0271 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  98.88 
 
 		 625 aa  1274    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  54.63 
 
 		 677 aa  778    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  56.12 
 
 		 678 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  100 
 
 		 675 aa  1387    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  67.41 
 
 		 686 aa  968    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  66.12 
 
 		 682 aa  956    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  54.55 
 
 		 677 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  51.86 
 
 		 694 aa  747    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  55.07 
 
 		 677 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  64.84 
 
 		 679 aa  937    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  66.57 
 
 		 684 aa  977    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  46.85 
 
 		 690 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  42.6 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  49.33 
 
 		 646 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  49.33 
 
 		 646 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  42.11 
 
 		 675 aa  497  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  45.61 
 
 		 634 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  42.23 
 
 		 636 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.86 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.97 
 
 		 599 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  38.1 
 
 		 617 aa  293  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.76 
 
 		 652 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 604 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  41 
 
 		 605 aa  286  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.32 
 
 		 614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.12 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.97 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.88 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.85 
 
 		 604 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.44 
 
 		 574 aa  282  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.73 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.13 
 
 		 600 aa  281  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.02 
 
 		 656 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.02 
 
 		 595 aa  280  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.38 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.74 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  35.7 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.57 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.76 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.76 
 
 		 584 aa  278  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.28 
 
 		 676 aa  278  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  37.77 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.87 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  39.52 
 
 		 638 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.53 
 
 		 584 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  34.47 
 
 		 651 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  37.29 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.95 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.83 
 
 		 581 aa  274  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.19 
 
 		 595 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  37.7 
 
 		 652 aa  273  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  37.05 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.97 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  37.05 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  37.05 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.82 
 
 		 660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  37.29 
 
 		 584 aa  271  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.75 
 
 		 663 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.36 
 
 		 613 aa  270  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.87 
 
 		 598 aa  270  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.98 
 
 		 651 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.98 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.04 
 
 		 674 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.98 
 
 		 660 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  40 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.37 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  38.89 
 
 		 622 aa  269  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.91 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.52 
 
 		 664 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.91 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.91 
 
 		 582 aa  269  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.65 
 
 		 571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  39.26 
 
 		 623 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.17 
 
 		 655 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.98 
 
 		 660 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  39.24 
 
 		 603 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.62 
 
 		 601 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.71 
 
 		 601 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.61 
 
 		 599 aa  266  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  34.4 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.52 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.52 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.52 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.52 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.23 
 
 		 596 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.52 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  38.53 
 
 		 631 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  34.98 
 
 		 662 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.33 
 
 		 653 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.82 
 
 		 587 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  29.89 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  29.89 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  29.89 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  29.89 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  29.89 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>