More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07051 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  56.4 
 
 		 677 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  64.84 
 
 		 675 aa  937    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  57.16 
 
 		 678 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  70.9 
 
 		 686 aa  986    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  71.11 
 
 		 682 aa  1011    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  56.4 
 
 		 677 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  55.93 
 
 		 694 aa  781    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  100 
 
 		 679 aa  1395    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  62.98 
 
 		 625 aa  842    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  55.95 
 
 		 677 aa  796    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  73.33 
 
 		 684 aa  1038    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  47.83 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  48.4 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  49.12 
 
 		 646 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  49.12 
 
 		 646 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  46.79 
 
 		 636 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  47.74 
 
 		 634 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  47.46 
 
 		 675 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.59 
 
 		 595 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.48 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.1 
 
 		 604 aa  295  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.81 
 
 		 588 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.4 
 
 		 656 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.29 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  40.27 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.33 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.8 
 
 		 613 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.62 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.38 
 
 		 613 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.91 
 
 		 574 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.62 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.02 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.38 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.01 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.18 
 
 		 599 aa  279  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.12 
 
 		 600 aa  279  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  38.95 
 
 		 652 aa  279  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.05 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  39.18 
 
 		 571 aa  278  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  38.66 
 
 		 576 aa  278  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.09 
 
 		 652 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.29 
 
 		 595 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.7 
 
 		 676 aa  278  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.92 
 
 		 581 aa  277  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.92 
 
 		 581 aa  277  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.64 
 
 		 587 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.09 
 
 		 655 aa  276  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.71 
 
 		 660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.85 
 
 		 651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.57 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.82 
 
 		 595 aa  275  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.57 
 
 		 638 aa  274  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.92 
 
 		 582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.33 
 
 		 660 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.1 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  36.17 
 
 		 574 aa  273  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  36.17 
 
 		 574 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.65 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  36.92 
 
 		 584 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.95 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  37.65 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35.96 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.13 
 
 		 583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.47 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.91 
 
 		 614 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  37.53 
 
 		 574 aa  270  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  33.65 
 
 		 652 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  37.44 
 
 		 575 aa  270  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  36.53 
 
 		 553 aa  270  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  41.76 
 
 		 574 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.72 
 
 		 664 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  36.84 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.3 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.3 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.3 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38 
 
 		 674 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.3 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  41.48 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.17 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.3 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  41.48 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  36.3 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  36.53 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  41.48 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  41.48 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  41.93 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.41 
 
 		 601 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.51 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.71 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  35.61 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.98 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.98 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>