More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5107 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  58.97 
 
 		 646 aa  745    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  58.97 
 
 		 646 aa  745    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  100 
 
 		 634 aa  1306    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  53.2 
 
 		 640 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  51.56 
 
 		 636 aa  621  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  52.47 
 
 		 675 aa  621  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  50.81 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  53.3 
 
 		 694 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  47.74 
 
 		 679 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  47.37 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  46.95 
 
 		 682 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  42.46 
 
 		 684 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  45.61 
 
 		 675 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  42.57 
 
 		 677 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  41.65 
 
 		 678 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  41.91 
 
 		 677 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  44.66 
 
 		 677 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  44.22 
 
 		 625 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.92 
 
 		 605 aa  317  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.98 
 
 		 599 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.15 
 
 		 613 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 604 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  42.35 
 
 		 596 aa  290  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.39 
 
 		 663 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.32 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.69 
 
 		 595 aa  287  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.38 
 
 		 651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.15 
 
 		 664 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  44.69 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.15 
 
 		 655 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  44.29 
 
 		 660 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  44.69 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.13 
 
 		 652 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.17 
 
 		 617 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  44.41 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  42.82 
 
 		 656 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.97 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.72 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.34 
 
 		 638 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.66 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.34 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.68 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.65 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.45 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.12 
 
 		 584 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.9 
 
 		 582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.46 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.46 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.97 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.3 
 
 		 583 aa  273  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.71 
 
 		 663 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.83 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.58 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  40.22 
 
 		 676 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  39 
 
 		 553 aa  271  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.41 
 
 		 613 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  38.16 
 
 		 584 aa  270  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  36.03 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.53 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  38.76 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  42.5 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.22 
 
 		 660 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.88 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  30.5 
 
 		 604 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.55 
 
 		 599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.3 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.35 
 
 		 666 aa  267  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  39.95 
 
 		 614 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.82 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.82 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  40.05 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.82 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  35.51 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.82 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.9 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  41.58 
 
 		 645 aa  263  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  40.1 
 
 		 601 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.41 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  37.86 
 
 		 659 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  45.68 
 
 		 603 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.85 
 
 		 614 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.47 
 
 		 626 aa  262  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.52 
 
 		 588 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  40 
 
 		 625 aa  262  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  38.13 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  38.92 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>