More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0735 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  50.43 
 
 
690 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  57.98 
 
 
640 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  55.29 
 
 
636 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  55.29 
 
 
646 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  100 
 
 
675 aa  1388    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  55.29 
 
 
646 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  49.53 
 
 
694 aa  628  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  52.61 
 
 
634 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  41.15 
 
 
684 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  42.16 
 
 
682 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  47.37 
 
 
686 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  47.46 
 
 
679 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  42.68 
 
 
675 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  40.2 
 
 
677 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  43.3 
 
 
678 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  41.8 
 
 
677 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  41.44 
 
 
677 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  41.68 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.86 
 
 
605 aa  326  8.000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.03 
 
 
604 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.91 
 
 
601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  40.67 
 
 
613 aa  310  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.33 
 
 
595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.08 
 
 
598 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  40.48 
 
 
599 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.44 
 
 
604 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.23 
 
 
600 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.73 
 
 
599 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40 
 
 
599 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.73 
 
 
588 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.55 
 
 
626 aa  293  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.96 
 
 
605 aa  290  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.29 
 
 
583 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.7 
 
 
614 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.19 
 
 
582 aa  287  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.26 
 
 
587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.36 
 
 
651 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.61 
 
 
619 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.44 
 
 
587 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.05 
 
 
652 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  43.1 
 
 
663 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  41.94 
 
 
577 aa  280  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.49 
 
 
656 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  36.73 
 
 
584 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.24 
 
 
601 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  36.02 
 
 
584 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.35 
 
 
581 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.57 
 
 
660 aa  278  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  37.35 
 
 
581 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.35 
 
 
581 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.35 
 
 
581 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.35 
 
 
581 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.63 
 
 
581 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  38.2 
 
 
583 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  36.63 
 
 
584 aa  277  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.63 
 
 
595 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  42.54 
 
 
664 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  36.87 
 
 
584 aa  277  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.39 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.54 
 
 
660 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.39 
 
 
582 aa  276  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.97 
 
 
660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.24 
 
 
600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.94 
 
 
598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  40.38 
 
 
574 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.94 
 
 
598 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.94 
 
 
596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.97 
 
 
660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.71 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.97 
 
 
660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  40.38 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  40.38 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  38.63 
 
 
598 aa  275  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  40.11 
 
 
574 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.69 
 
 
651 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  36.87 
 
 
581 aa  274  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.14 
 
 
581 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.14 
 
 
581 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.71 
 
 
598 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.2 
 
 
595 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.41 
 
 
652 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.13 
 
 
582 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  37.37 
 
 
586 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.13 
 
 
582 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.13 
 
 
582 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.27 
 
 
676 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.18 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.56 
 
 
598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.72 
 
 
598 aa  271  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  39.32 
 
 
574 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.78 
 
 
655 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>