More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0860 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  97.64 
 
 		 677 aa  1348    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  53.26 
 
 		 625 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  82.94 
 
 		 678 aa  1158    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  54.55 
 
 		 675 aa  770    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  56.4 
 
 		 679 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  53.77 
 
 		 684 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  54.13 
 
 		 686 aa  800    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  52.75 
 
 		 682 aa  792    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  100 
 
 		 677 aa  1377    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  46.49 
 
 		 694 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  97.05 
 
 		 677 aa  1341    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  40.29 
 
 		 690 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  40.03 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  43.87 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  43.87 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  44.62 
 
 		 636 aa  470  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  44.66 
 
 		 634 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  39.87 
 
 		 675 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.91 
 
 		 599 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.31 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.18 
 
 		 601 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.25 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  31.04 
 
 		 601 aa  276  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.86 
 
 		 600 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.44 
 
 		 601 aa  275  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.26 
 
 		 595 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  33.87 
 
 		 613 aa  273  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.49 
 
 		 655 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.67 
 
 		 626 aa  273  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.41 
 
 		 656 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.73 
 
 		 652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.36 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.71 
 
 		 651 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.99 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.99 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.65 
 
 		 664 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.24 
 
 		 638 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.33 
 
 		 600 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.8 
 
 		 613 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.8 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.72 
 
 		 617 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.49 
 
 		 614 aa  265  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.05 
 
 		 588 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.04 
 
 		 660 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.05 
 
 		 660 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  32.33 
 
 		 655 aa  264  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.16 
 
 		 595 aa  264  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.94 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.8 
 
 		 599 aa  263  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.94 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.12 
 
 		 636 aa  263  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.04 
 
 		 660 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.93 
 
 		 663 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.85 
 
 		 585 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.04 
 
 		 660 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.89 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.35 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.19 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.69 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  30.45 
 
 		 598 aa  261  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  29.7 
 
 		 652 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  260  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.19 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.43 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.56 
 
 		 674 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.21 
 
 		 617 aa  257  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  32.16 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  35.03 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  32.94 
 
 		 645 aa  256  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.32 
 
 		 660 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  33.02 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  32.28 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  34.86 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  33.79 
 
 		 622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.33 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.28 
 
 		 590 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  33.71 
 
 		 623 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.25 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.43 
 
 		 572 aa  254  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.43 
 
 		 553 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.35 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.41 
 
 		 584 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.46 
 
 		 633 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  33.33 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.66 
 
 		 599 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.18 
 
 		 584 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>