More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2944 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  100 
 
 		 591 aa  1170    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0485  DNA primase  44.92 
 
 		 595 aa  361  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.62 
 
 		 599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  40.09 
 
 		 600 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.09 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  41.27 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  41.27 
 
 		 595 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  31.22 
 
 		 588 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.53 
 
 		 587 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  44.17 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.55 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.65 
 
 		 587 aa  287  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  40.17 
 
 		 611 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.62 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  38 
 
 		 631 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.01 
 
 		 636 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.39 
 
 		 633 aa  281  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  30.35 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.39 
 
 		 601 aa  280  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.78 
 
 		 544 aa  279  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  30.56 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.58 
 
 		 600 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.36 
 
 		 595 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.02 
 
 		 617 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  36 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.28 
 
 		 571 aa  275  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.94 
 
 		 593 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.42 
 
 		 630 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.75 
 
 		 660 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.56 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.52 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.28 
 
 		 598 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.52 
 
 		 598 aa  273  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  32.7 
 
 		 676 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  32.91 
 
 		 604 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  35.55 
 
 		 632 aa  270  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  31.49 
 
 		 599 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.74 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  30.94 
 
 		 564 aa  266  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.14 
 
 		 601 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  38.11 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  32.66 
 
 		 660 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  34.16 
 
 		 632 aa  264  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.54 
 
 		 626 aa  264  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.75 
 
 		 663 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  29.28 
 
 		 601 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.2 
 
 		 638 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.89 
 
 		 664 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.91 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.14 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  35.86 
 
 		 653 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.38 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  30 
 
 		 585 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  33.41 
 
 		 614 aa  260  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.14 
 
 		 660 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.99 
 
 		 645 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  32.51 
 
 		 572 aa  259  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  33.65 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.91 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.04 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  32.28 
 
 		 553 aa  258  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.2 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  33.54 
 
 		 590 aa  257  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.56 
 
 		 656 aa  256  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  33.9 
 
 		 552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  35.31 
 
 		 576 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  35.8 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  31.84 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.63 
 
 		 613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.45 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  35.12 
 
 		 595 aa  254  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  33.63 
 
 		 625 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  34.05 
 
 		 575 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  34.87 
 
 		 619 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  33.49 
 
 		 631 aa  253  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  29.72 
 
 		 623 aa  253  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.2 
 
 		 651 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.49 
 
 		 539 aa  253  9.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.71 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  29.72 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.41 
 
 		 663 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  32.87 
 
 		 571 aa  252  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  33.86 
 
 		 578 aa  252  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.62 
 
 		 652 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  33.17 
 
 		 581 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.57 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.17 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.17 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.57 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.57 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.57 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.57 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.17 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>