More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2490 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  100 
 
 		 606 aa  1214    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  55.39 
 
 		 658 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  55.57 
 
 		 653 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  56.74 
 
 		 625 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  57.19 
 
 		 660 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  53.95 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  59.85 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  64.47 
 
 		 676 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1407  DNA primase  70.41 
 
 		 674 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  65.64 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  53.97 
 
 		 653 aa  584  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  52.48 
 
 		 604 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  58.76 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  58.76 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  57.34 
 
 		 638 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  49.53 
 
 		 630 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  63.44 
 
 		 636 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  57.62 
 
 		 645 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  62.12 
 
 		 623 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  56.67 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  62.5 
 
 		 622 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  56.67 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  57.37 
 
 		 613 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  56.47 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  53.07 
 
 		 603 aa  515  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  50.49 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  58.07 
 
 		 603 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  61.73 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0620  DNA primase  62.53 
 
 		 625 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  62.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  57.93 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  53.59 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  50.98 
 
 		 592 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  52.49 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  54.5 
 
 		 656 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  50.43 
 
 		 576 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  51 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  50.56 
 
 		 652 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  50.56 
 
 		 651 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  50 
 
 		 660 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  47.16 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  50 
 
 		 663 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  49.78 
 
 		 664 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  51.29 
 
 		 663 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  50.56 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  49.32 
 
 		 660 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  49.55 
 
 		 660 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  46.97 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  51.24 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  45.56 
 
 		 576 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  49.67 
 
 		 638 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  45.92 
 
 		 586 aa  399  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  44.15 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  41.63 
 
 		 578 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  45.76 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  47.88 
 
 		 585 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  46.36 
 
 		 574 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  48.1 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  47.64 
 
 		 614 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  44.59 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  47.26 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  46.38 
 
 		 613 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  47.39 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  44.1 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  50.85 
 
 		 571 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  47.17 
 
 		 581 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  48.64 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  45.65 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  44.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  44.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  44.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  45.81 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  44.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  45.65 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  45.65 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  44.44 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  49.88 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  46.64 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  50.12 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  46.19 
 
 		 584 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  45.82 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  43.98 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  44.35 
 
 		 572 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  45.14 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  43.61 
 
 		 582 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  44.12 
 
 		 553 aa  364  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  42.91 
 
 		 575 aa  362  9e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  46.06 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>