More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1030 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  100 
 
 		 530 aa  1059    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  50.45 
 
 		 560 aa  518  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  39.96 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  39.96 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  35.85 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.26 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  41.97 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  40.99 
 
 		 539 aa  253  8.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  33.1 
 
 		 578 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.84 
 
 		 599 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.33 
 
 		 583 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.29 
 
 		 588 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.6 
 
 		 578 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.69 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.4 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.43 
 
 		 587 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  38.67 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.63 
 
 		 587 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  39.06 
 
 		 617 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  34.04 
 
 		 577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.18 
 
 		 601 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  37.47 
 
 		 636 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36 
 
 		 660 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  35.64 
 
 		 631 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.38 
 
 		 645 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  36.87 
 
 		 594 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.59 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.48 
 
 		 675 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.55 
 
 		 605 aa  240  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.32 
 
 		 599 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  35.67 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.76 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.23 
 
 		 613 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.85 
 
 		 599 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.67 
 
 		 614 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  37.3 
 
 		 677 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  30.08 
 
 		 603 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.24 
 
 		 598 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.93 
 
 		 605 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.93 
 
 		 605 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  37.5 
 
 		 595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.43 
 
 		 598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  38.37 
 
 		 535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.71 
 
 		 604 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  35.49 
 
 		 550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.34 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  30.52 
 
 		 603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.41 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.47 
 
 		 676 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  34.6 
 
 		 634 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.81 
 
 		 600 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.93 
 
 		 598 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.93 
 
 		 598 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.16 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  41.82 
 
 		 623 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.97 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  33.41 
 
 		 625 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.34 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.33 
 
 		 632 aa  230  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.24 
 
 		 646 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  34.62 
 
 		 622 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.24 
 
 		 646 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.34 
 
 		 574 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  34.36 
 
 		 622 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  30.93 
 
 		 647 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  34.75 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.02 
 
 		 598 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.53 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  32.26 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  34.35 
 
 		 625 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  36.65 
 
 		 659 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  34.35 
 
 		 625 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  28.98 
 
 		 604 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  37.33 
 
 		 677 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  37.75 
 
 		 679 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  34.6 
 
 		 652 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  37.33 
 
 		 677 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  31.68 
 
 		 571 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  37.2 
 
 		 578 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  35.75 
 
 		 675 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.24 
 
 		 640 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.58 
 
 		 626 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  35.48 
 
 		 606 aa  226  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  34.28 
 
 		 565 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  34.36 
 
 		 638 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.64 
 
 		 694 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  34.62 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  38.01 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  28.95 
 
 		 603 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  34.1 
 
 		 800 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  32.33 
 
 		 684 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  34.34 
 
 		 583 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  33.56 
 
 		 686 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  36.34 
 
 		 572 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>