More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1531 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  100 
 
 		 535 aa  1076    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  42.37 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.99 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.68 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.47 
 
 		 599 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  39.84 
 
 		 560 aa  256  8e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.5 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.54 
 
 		 588 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.28 
 
 		 584 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.5 
 
 		 587 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.2 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.85 
 
 		 619 aa  240  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.9 
 
 		 617 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 604 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  33.98 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  36.49 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.89 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  34.23 
 
 		 577 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  34.23 
 
 		 577 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.09 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.09 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  38.37 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  37.35 
 
 		 564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  34.53 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  36.61 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.53 
 
 		 599 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.76 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.43 
 
 		 614 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  34.92 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  38.61 
 
 		 591 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.26 
 
 		 660 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.42 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  34.4 
 
 		 577 aa  230  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  36.84 
 
 		 550 aa  230  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.24 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  29.84 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  37.36 
 
 		 595 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  32.28 
 
 		 618 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.06 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.26 
 
 		 626 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.09 
 
 		 600 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  35.03 
 
 		 577 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  37.13 
 
 		 595 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.77 
 
 		 571 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.52 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.66 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.53 
 
 		 646 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.77 
 
 		 598 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  33.04 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.53 
 
 		 646 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.13 
 
 		 703 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  34.77 
 
 		 673 aa  224  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  33.9 
 
 		 595 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.51 
 
 		 600 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.51 
 
 		 598 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  34.59 
 
 		 611 aa  223  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.04 
 
 		 598 aa  223  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  37.02 
 
 		 704 aa  221  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  35.9 
 
 		 546 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  33.51 
 
 		 682 aa  220  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.24 
 
 		 599 aa  220  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.95 
 
 		 656 aa  220  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.81 
 
 		 651 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  33.77 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  33.43 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.16 
 
 		 694 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  32.21 
 
 		 629 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  32.12 
 
 		 638 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.05 
 
 		 660 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  33.81 
 
 		 652 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.05 
 
 		 655 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.35 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  33.43 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  31.58 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.25 
 
 		 596 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.24 
 
 		 601 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  31.28 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  33.67 
 
 		 675 aa  217  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  34.05 
 
 		 582 aa  216  9e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.14 
 
 		 663 aa  216  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  31.12 
 
 		 594 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  33.95 
 
 		 684 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  30.66 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  32.45 
 
 		 640 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  34.41 
 
 		 674 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  34.09 
 
 		 679 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  30.31 
 
 		 676 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.96 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  36.47 
 
 		 657 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  38.11 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  36.69 
 
 		 690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>