More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1790 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  58.66 
 
 		 656 aa  792    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  59.68 
 
 		 657 aa  815    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  100 
 
 		 704 aa  1452    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  42.18 
 
 		 660 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  56.38 
 
 		 653 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  43.07 
 
 		 674 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  49.11 
 
 		 662 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  43.13 
 
 		 673 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  48.21 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.18 
 
 		 640 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.73 
 
 		 619 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  39.11 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  33.85 
 
 		 660 aa  320  6e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  43.09 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  40.52 
 
 		 636 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.15 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.9 
 
 		 588 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.41 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.18 
 
 		 582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  39.17 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.41 
 
 		 583 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.06 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  39.12 
 
 		 633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.22 
 
 		 599 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  38.18 
 
 		 631 aa  300  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.96 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.36 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.58 
 
 		 600 aa  293  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.58 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.58 
 
 		 598 aa  293  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.52 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.36 
 
 		 588 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.76 
 
 		 638 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.29 
 
 		 663 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.58 
 
 		 593 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.95 
 
 		 598 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.75 
 
 		 664 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.78 
 
 		 600 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.7 
 
 		 595 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.5 
 
 		 663 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.71 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.23 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.95 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.91 
 
 		 614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.27 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.2 
 
 		 604 aa  266  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.08 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  36.73 
 
 		 684 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  32.65 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.48 
 
 		 655 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  33.26 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  33.26 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.19 
 
 		 617 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.33 
 
 		 651 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.2 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  32.88 
 
 		 652 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.13 
 
 		 613 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  33.56 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.33 
 
 		 660 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.63 
 
 		 604 aa  257  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.33 
 
 		 660 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.6 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.08 
 
 		 694 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.7 
 
 		 544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.36 
 
 		 660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.64 
 
 		 666 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.1 
 
 		 660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.38 
 
 		 613 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  35.68 
 
 		 682 aa  254  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.81 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.81 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.7 
 
 		 676 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.81 
 
 		 578 aa  253  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  32.38 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  33.47 
 
 		 647 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  34.63 
 
 		 617 aa  251  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  32.71 
 
 		 640 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.12 
 
 		 686 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  34 
 
 		 616 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  36.79 
 
 		 675 aa  249  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  36.89 
 
 		 583 aa  248  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.96 
 
 		 585 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  36.45 
 
 		 679 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  32.82 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  31.27 
 
 		 667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  36.62 
 
 		 576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  33.64 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  34.72 
 
 		 591 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.06 
 
 		 614 aa  245  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.16 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.73 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.73 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.73 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.73 
 
 		 581 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>