More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0910 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  100 
 
 		 656 aa  1351    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  57.6 
 
 		 657 aa  767    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  58.66 
 
 		 704 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  44.46 
 
 		 653 aa  545  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  56.61 
 
 		 660 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  45.94 
 
 		 662 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  44.8 
 
 		 673 aa  480  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  49.67 
 
 		 674 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  39.47 
 
 		 703 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.47 
 
 		 640 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.79 
 
 		 619 aa  349  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.52 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.97 
 
 		 636 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.37 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  39.5 
 
 		 632 aa  327  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.36 
 
 		 660 aa  321  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  34.21 
 
 		 631 aa  319  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  38.03 
 
 		 630 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.53 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  31.73 
 
 		 633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.92 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.61 
 
 		 587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.47 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.29 
 
 		 582 aa  293  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.43 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.53 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.92 
 
 		 626 aa  290  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  32.69 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  280  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  280  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  279  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.4 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.42 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.4 
 
 		 595 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.64 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.86 
 
 		 598 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  34.99 
 
 		 617 aa  276  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.64 
 
 		 598 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.72 
 
 		 593 aa  276  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.97 
 
 		 604 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.33 
 
 		 613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.27 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.3 
 
 		 614 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  31.87 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.35 
 
 		 638 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.84 
 
 		 539 aa  272  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.41 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.46 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.28 
 
 		 663 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.49 
 
 		 601 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.19 
 
 		 664 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.3 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.83 
 
 		 605 aa  266  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.52 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.52 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  30.3 
 
 		 694 aa  264  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  263  8.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.1 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.02 
 
 		 660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.15 
 
 		 611 aa  260  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.56 
 
 		 655 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.83 
 
 		 651 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.89 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  32.79 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  34.69 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.98 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.54 
 
 		 652 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.79 
 
 		 660 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 604 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  32.51 
 
 		 600 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  30.14 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.57 
 
 		 646 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.57 
 
 		 646 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  34.45 
 
 		 617 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  37.63 
 
 		 583 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  31.65 
 
 		 544 aa  252  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  34.75 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  32.99 
 
 		 684 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.41 
 
 		 614 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  33.79 
 
 		 660 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  33.33 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.39 
 
 		 585 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.64 
 
 		 591 aa  249  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  39.49 
 
 		 634 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  32.59 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  36.06 
 
 		 642 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  39.49 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  36.49 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.56 
 
 		 605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  34.38 
 
 		 647 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.2 
 
 		 676 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  31.91 
 
 		 601 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  38.07 
 
 		 671 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.79 
 
 		 675 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.09 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  32.59 
 
 		 682 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>