More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0175 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0175  DNA primase  100 
 
 		 600 aa  1244    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.8 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.76 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.71 
 
 		 605 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  32.51 
 
 		 656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.1 
 
 		 653 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.68 
 
 		 578 aa  250  7e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.33 
 
 		 587 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.76 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.72 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  33.19 
 
 		 703 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.46 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.81 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  30.31 
 
 		 571 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  32.09 
 
 		 662 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  36.26 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  28.08 
 
 		 595 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.16 
 
 		 626 aa  240  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  32.59 
 
 		 657 aa  239  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.8 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.1 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  32.16 
 
 		 636 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  30.8 
 
 		 634 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  32.95 
 
 		 660 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.22 
 
 		 588 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.97 
 
 		 599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  33.87 
 
 		 674 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  28.69 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.58 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.06 
 
 		 584 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  33.02 
 
 		 655 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  30.36 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  36.21 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  34.49 
 
 		 619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.35 
 
 		 623 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  28.75 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  32.19 
 
 		 626 aa  233  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.36 
 
 		 583 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  31.89 
 
 		 618 aa  230  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  32.52 
 
 		 550 aa  229  9e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.18 
 
 		 582 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.18 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.03 
 
 		 600 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  34.52 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  33.65 
 
 		 628 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.89 
 
 		 614 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  31.24 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  31.38 
 
 		 642 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  30.87 
 
 		 605 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  31.69 
 
 		 593 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  31.51 
 
 		 639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  31.41 
 
 		 673 aa  221  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.25 
 
 		 595 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  32.6 
 
 		 655 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.79 
 
 		 694 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  34.93 
 
 		 582 aa  220  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  31.4 
 
 		 651 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.55 
 
 		 604 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  36.01 
 
 		 616 aa  220  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  31.53 
 
 		 640 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  35.29 
 
 		 637 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  32.11 
 
 		 642 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  35.32 
 
 		 629 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.17 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  31 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.63 
 
 		 579 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.37 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  38.55 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  31 
 
 		 605 aa  218  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  31.81 
 
 		 652 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  31 
 
 		 614 aa  218  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  38.55 
 
 		 577 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  32.12 
 
 		 546 aa  217  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  31.93 
 
 		 595 aa  217  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  32.44 
 
 		 576 aa  216  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  31.7 
 
 		 656 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  31.94 
 
 		 632 aa  216  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  32.47 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  30.38 
 
 		 623 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.22 
 
 		 646 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.22 
 
 		 646 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  31.99 
 
 		 617 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  32.84 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.86 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  31.3 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.86 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  29.03 
 
 		 596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  31.15 
 
 		 655 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  33.17 
 
 		 621 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.08 
 
 		 640 aa  213  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  29.77 
 
 		 645 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  31.54 
 
 		 601 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>