More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1345 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1345  DNA primase  100 
 
 		 595 aa  1227    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0733  hypothetical protein  35.5 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  32.32 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 604 aa  299  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  32.74 
 
 		 598 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.41 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.68 
 
 		 599 aa  293  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.42 
 
 		 596 aa  292  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.44 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  31.34 
 
 		 600 aa  290  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.16 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  31.1 
 
 		 598 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  31.1 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.8 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.45 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.41 
 
 		 626 aa  283  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.04 
 
 		 604 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.3 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.81 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.14 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36 
 
 		 660 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.76 
 
 		 660 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.46 
 
 		 588 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  31.16 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.76 
 
 		 655 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.53 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.32 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36 
 
 		 652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.29 
 
 		 660 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.73 
 
 		 663 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36 
 
 		 651 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.29 
 
 		 604 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  35.76 
 
 		 599 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.06 
 
 		 663 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.28 
 
 		 664 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.81 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.81 
 
 		 584 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  30.54 
 
 		 617 aa  263  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.05 
 
 		 613 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.7 
 
 		 638 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.88 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.12 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  29.98 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  33.2 
 
 		 584 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  30.61 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.82 
 
 		 544 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  37.9 
 
 		 576 aa  259  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  28.35 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.88 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.53 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  37.09 
 
 		 599 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  29.83 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.38 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  31.51 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  29.62 
 
 		 586 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  29.2 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  32.79 
 
 		 583 aa  258  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  28.79 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  30.92 
 
 		 550 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35 
 
 		 574 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  28.55 
 
 		 581 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  28.55 
 
 		 581 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.07 
 
 		 583 aa  256  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  28.55 
 
 		 581 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  29.79 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  31.8 
 
 		 593 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  28.77 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  28.62 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  34.76 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  30.19 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  28.62 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  33.97 
 
 		 656 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  34.52 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  34.52 
 
 		 574 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  36.71 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.05 
 
 		 574 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  36.39 
 
 		 576 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.51 
 
 		 575 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  29.2 
 
 		 584 aa  253  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.59 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  32.7 
 
 		 584 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.41 
 
 		 578 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  28.4 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.81 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  28.4 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  28.4 
 
 		 582 aa  252  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.2 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.31 
 
 		 632 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>