More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1497 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1810  DNA primase  59.33 
 
 		 605 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  59.33 
 
 		 605 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  59.33 
 
 		 614 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  100 
 
 		 595 aa  1196    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  50 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  48.62 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  46.36 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  45.79 
 
 		 572 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  41.85 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  38.58 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 604 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.77 
 
 		 595 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  37.71 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  35.08 
 
 		 591 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.91 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  30.84 
 
 		 587 aa  253  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.65 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.65 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.65 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  29.71 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.65 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.65 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  32.05 
 
 		 592 aa  249  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.39 
 
 		 656 aa  249  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.64 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.97 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  35.47 
 
 		 577 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  35.47 
 
 		 578 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.6 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.43 
 
 		 655 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.03 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  34.29 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.34 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.34 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.34 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  35.34 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.77 
 
 		 664 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  29.3 
 
 		 588 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.71 
 
 		 599 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  32.77 
 
 		 594 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.86 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.86 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.86 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  30.57 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  30.4 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  30.07 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.03 
 
 		 584 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  33.26 
 
 		 578 aa  241  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.82 
 
 		 584 aa  240  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.42 
 
 		 652 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.69 
 
 		 584 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  31.22 
 
 		 596 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  28.92 
 
 		 652 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.14 
 
 		 651 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.11 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  33.18 
 
 		 700 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.6 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.65 
 
 		 660 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.95 
 
 		 544 aa  237  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  26.89 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  32.43 
 
 		 660 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.92 
 
 		 638 aa  237  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  32.43 
 
 		 660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  30.97 
 
 		 677 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  31.87 
 
 		 599 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  34.46 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  32.43 
 
 		 660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  30.43 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.14 
 
 		 663 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.34 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  33.64 
 
 		 651 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  33.42 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  33.42 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.19 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  34.75 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  32.69 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  29.11 
 
 		 579 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  32.86 
 
 		 583 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  31.83 
 
 		 601 aa  233  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.96 
 
 		 613 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  32.86 
 
 		 583 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.72 
 
 		 599 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  31.12 
 
 		 614 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  31.21 
 
 		 629 aa  233  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.53 
 
 		 571 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  33.25 
 
 		 592 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.29 
 
 		 598 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  30.56 
 
 		 655 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>