More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0348 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0348  DNA primase  100 
 
 
582 aa  1189    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  41.62 
 
 
588 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0314  DNA primase  40.64 
 
 
604 aa  434  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  35.93 
 
 
633 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  32.72 
 
 
629 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  37.15 
 
 
621 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  37.38 
 
 
623 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  38.57 
 
 
625 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  33.63 
 
 
639 aa  290  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  38.6 
 
 
680 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  33.58 
 
 
629 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  38.2 
 
 
627 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  36.32 
 
 
655 aa  286  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  36.32 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  32.83 
 
 
620 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  35.44 
 
 
666 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  38.59 
 
 
669 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  38.32 
 
 
685 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  39.42 
 
 
671 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  37.5 
 
 
641 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  37.9 
 
 
641 aa  280  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  37.16 
 
 
642 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  38 
 
 
671 aa  280  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  35.95 
 
 
669 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  36.92 
 
 
656 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  36.9 
 
 
633 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  35.77 
 
 
634 aa  277  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  37.64 
 
 
683 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  37.7 
 
 
669 aa  277  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  36.2 
 
 
647 aa  276  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  36.78 
 
 
639 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  37.06 
 
 
678 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  36.14 
 
 
646 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  33.45 
 
 
646 aa  273  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  36.49 
 
 
665 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  34.09 
 
 
643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  33.9 
 
 
643 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.94 
 
 
651 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  42.43 
 
 
571 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.35 
 
 
652 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  36.71 
 
 
641 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.06 
 
 
660 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  34.97 
 
 
654 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  32.36 
 
 
609 aa  263  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.01 
 
 
599 aa  263  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.76 
 
 
660 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.76 
 
 
660 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.06 
 
 
655 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  38.83 
 
 
575 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.47 
 
 
660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.93 
 
 
638 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  34.05 
 
 
576 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  34.96 
 
 
583 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  37.4 
 
 
574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  37.4 
 
 
574 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.37 
 
 
601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  41.18 
 
 
663 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  32.79 
 
 
613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  37.4 
 
 
574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  37.4 
 
 
574 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  38.72 
 
 
572 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  31.93 
 
 
617 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  35.37 
 
 
574 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  34.23 
 
 
575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  38.72 
 
 
553 aa  254  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  29.4 
 
 
619 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  42.07 
 
 
576 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  34.62 
 
 
646 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.3 
 
 
664 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.3 
 
 
663 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  33.33 
 
 
686 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.92 
 
 
574 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  40.59 
 
 
574 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  33.75 
 
 
679 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  40.76 
 
 
573 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  34.92 
 
 
574 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  42.47 
 
 
587 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  40.16 
 
 
584 aa  251  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  40.59 
 
 
574 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.71 
 
 
599 aa  250  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  38.16 
 
 
609 aa  250  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  41.05 
 
 
577 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  42.77 
 
 
544 aa  249  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.02 
 
 
645 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.63 
 
 
656 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  35.81 
 
 
574 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2262  DNA primase  30.33 
 
 
650 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.9199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.02 
 
 
640 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  40.82 
 
 
660 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  40.64 
 
 
626 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  39.25 
 
 
577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  39.25 
 
 
578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  39.71 
 
 
576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.65 
 
 
592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  38.72 
 
 
564 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  39.7 
 
 
598 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  42.15 
 
 
600 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.54 
 
 
585 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  33.54 
 
 
684 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.19 
 
 
593 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>