More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0799 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  100 
 
 		 579 aa  1167    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  35.85 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  31.9 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  31.16 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  30.99 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.94 
 
 		 617 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.84 
 
 		 601 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 604 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.17 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.01 
 
 		 600 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.93 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.93 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.93 
 
 		 598 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  35.61 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.09 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  32.81 
 
 		 645 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.67 
 
 		 605 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  39.43 
 
 		 539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.61 
 
 		 599 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  36.61 
 
 		 564 aa  236  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  30.8 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  32.82 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  33.5 
 
 		 637 aa  233  6e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.61 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  32.41 
 
 		 647 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.61 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  36.61 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  33.25 
 
 		 652 aa  231  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  29.03 
 
 		 587 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.41 
 
 		 598 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.12 
 
 		 578 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  28.47 
 
 		 652 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.43 
 
 		 626 aa  228  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  33.16 
 
 		 619 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.68 
 
 		 599 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  37.67 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  30.39 
 
 		 676 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.92 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  32.15 
 
 		 647 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.19 
 
 		 632 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.11 
 
 		 590 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  33.42 
 
 		 621 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  29.52 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  30.13 
 
 		 660 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  30.05 
 
 		 613 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.6 
 
 		 584 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.57 
 
 		 587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  29.59 
 
 		 614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  26.19 
 
 		 604 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  29.52 
 
 		 603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0733  hypothetical protein  34.11 
 
 		 593 aa  221  3.9999999999999997e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.25 
 
 		 595 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  30.24 
 
 		 660 aa  220  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  31.92 
 
 		 651 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  33.78 
 
 		 587 aa  219  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  29.55 
 
 		 603 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.5 
 
 		 623 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.27 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  34.44 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  27.66 
 
 		 588 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  33.25 
 
 		 640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  30.3 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  27.8 
 
 		 606 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  31.25 
 
 		 577 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  32.36 
 
 		 581 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  30.61 
 
 		 656 aa  217  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  32.36 
 
 		 581 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  32.36 
 
 		 581 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  32.36 
 
 		 581 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.36 
 
 		 581 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  33.24 
 
 		 576 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  31.25 
 
 		 578 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.12 
 
 		 594 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.75 
 
 		 593 aa  216  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.67 
 
 		 611 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  35.47 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  30.95 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  30.12 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  32.27 
 
 		 660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  32 
 
 		 660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  32.81 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  29.89 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  32.41 
 
 		 588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.35 
 
 		 605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  32.1 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  25.84 
 
 		 606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  32.99 
 
 		 613 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  34.29 
 
 		 565 aa  213  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  32.17 
 
 		 573 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl269  DNA primase  31.52 
 
 		 626 aa  213  9e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  28.05 
 
 		 588 aa  213  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  27.48 
 
 		 585 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  32.53 
 
 		 578 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  32.47 
 
 		 604 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  29.63 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>