More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl269 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl269  DNA primase  100 
 
 		 626 aa  1248    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  36.54 
 
 		 604 aa  352  1e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.88 
 
 		 663 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.88 
 
 		 664 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.58 
 
 		 655 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  32.53 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  33.41 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.18 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.41 
 
 		 660 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.39 
 
 		 626 aa  256  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  32.08 
 
 		 638 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  32.61 
 
 		 613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  30.23 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  32.36 
 
 		 660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.33 
 
 		 651 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  33.33 
 
 		 652 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.74 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.74 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  32.29 
 
 		 663 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  26.63 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.16 
 
 		 593 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  29.66 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  29.66 
 
 		 571 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  29.66 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  29.66 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  29.66 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  29.66 
 
 		 598 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  29.47 
 
 		 598 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  29.47 
 
 		 598 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.56 
 
 		 599 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  34.23 
 
 		 617 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.92 
 
 		 595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  29.92 
 
 		 600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  29.47 
 
 		 598 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  27.98 
 
 		 614 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  29.14 
 
 		 598 aa  236  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  30.63 
 
 		 599 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  30.22 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.19 
 
 		 604 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  32.8 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  25.45 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  30 
 
 		 618 aa  234  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.62 
 
 		 600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  31.3 
 
 		 646 aa  234  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.33 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  34.7 
 
 		 571 aa  230  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  32.34 
 
 		 584 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  34.06 
 
 		 594 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  35.29 
 
 		 548 aa  229  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  32.98 
 
 		 609 aa  229  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  30.26 
 
 		 581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.68 
 
 		 660 aa  227  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  30.97 
 
 		 626 aa  227  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  32.8 
 
 		 586 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  30.75 
 
 		 611 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  32.61 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  28.73 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  30.66 
 
 		 619 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  32.62 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  29.78 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  30 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  29.48 
 
 		 582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  29.48 
 
 		 582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  29.48 
 
 		 582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  33.16 
 
 		 652 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  27.74 
 
 		 574 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  33.52 
 
 		 564 aa  223  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  32.51 
 
 		 603 aa  223  7e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  30.59 
 
 		 654 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  33.24 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  32.2 
 
 		 636 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  28.61 
 
 		 587 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  30.05 
 
 		 579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  29.08 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  31.5 
 
 		 573 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.31 
 
 		 601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  28.54 
 
 		 599 aa  221  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  33.14 
 
 		 565 aa  220  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  31.9 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  31.79 
 
 		 584 aa  220  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.21 
 
 		 595 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.88 
 
 		 601 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  31.06 
 
 		 656 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  34.54 
 
 		 565 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  32.01 
 
 		 574 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  32.01 
 
 		 574 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  29.08 
 
 		 621 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  31.84 
 
 		 643 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  26.38 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  30.1 
 
 		 581 aa  219  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.05 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  33.76 
 
 		 676 aa  219  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  32.35 
 
 		 642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>