More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1449 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1427  DNA primase  61.09 
 
 		 602 aa  754    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  100 
 
 		 603 aa  1252    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  42.68 
 
 		 637 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  39.9 
 
 		 621 aa  319  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  40.53 
 
 		 606 aa  316  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.07 
 
 		 605 aa  309  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.07 
 
 		 605 aa  309  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  40.71 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.19 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.22 
 
 		 571 aa  294  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.76 
 
 		 598 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.11 
 
 		 599 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.22 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.22 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.22 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.22 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.22 
 
 		 598 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.18 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.18 
 
 		 598 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.44 
 
 		 600 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.18 
 
 		 598 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.72 
 
 		 598 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.18 
 
 		 599 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.47 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.23 
 
 		 626 aa  267  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.14 
 
 		 613 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  35.32 
 
 		 610 aa  262  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  39.62 
 
 		 544 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.28 
 
 		 595 aa  260  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.87 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.74 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  29.9 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 604 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.3 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  34.75 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  37.08 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.28 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.66 
 
 		 583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.09 
 
 		 605 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  39.38 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.91 
 
 		 582 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.22 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  35.07 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  37.83 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  28.87 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.43 
 
 		 613 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  36.12 
 
 		 584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.01 
 
 		 676 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  34.02 
 
 		 660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  34.13 
 
 		 623 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  36.66 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.2 
 
 		 599 aa  244  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  31.25 
 
 		 587 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.13 
 
 		 623 aa  243  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.17 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  37.11 
 
 		 645 aa  243  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.59 
 
 		 601 aa  243  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.19 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  34.31 
 
 		 621 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.57 
 
 		 655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.5 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  32.39 
 
 		 664 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  32.93 
 
 		 652 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.57 
 
 		 663 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  33.19 
 
 		 655 aa  239  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  31.52 
 
 		 663 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  36.87 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  35.46 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  36.68 
 
 		 638 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  35.81 
 
 		 630 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  35.98 
 
 		 623 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.36 
 
 		 582 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  33.88 
 
 		 674 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  35.68 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  32.43 
 
 		 703 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  36.6 
 
 		 622 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  32.27 
 
 		 625 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  35.81 
 
 		 622 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  36.6 
 
 		 622 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.39 
 
 		 592 aa  237  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  35.04 
 
 		 584 aa  236  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  35.04 
 
 		 584 aa  236  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  35.18 
 
 		 609 aa  236  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  36.36 
 
 		 588 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.1 
 
 		 585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.96 
 
 		 626 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  33.66 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.39 
 
 		 611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  34.67 
 
 		 574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  31.66 
 
 		 660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.03 
 
 		 573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  31.45 
 
 		 660 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  34.67 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  35.53 
 
 		 657 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  34.67 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  34.67 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.25 
 
 		 565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  31.38 
 
 		 616 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  34.93 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  31.45 
 
 		 660 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>