More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1342 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  100 
 
 
565 aa  1135    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  99.29 
 
 
565 aa  1126    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  42.5 
 
 
560 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  39.96 
 
 
530 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  30.87 
 
 
579 aa  276  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.22 
 
 
595 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.04 
 
 
598 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.57 
 
 
571 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.38 
 
 
601 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.94 
 
 
600 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  38.16 
 
 
539 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.82 
 
 
599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.91 
 
 
588 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.36 
 
 
601 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.6 
 
 
598 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.89 
 
 
599 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.19 
 
 
598 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.3 
 
 
599 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  37.6 
 
 
550 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  37.99 
 
 
577 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  32.84 
 
 
552 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 
604 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  34.3 
 
 
583 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  34.55 
 
 
619 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.77 
 
 
666 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.48 
 
 
614 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.46 
 
 
571 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35 
 
 
614 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  30.78 
 
 
605 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.44 
 
 
611 aa  238  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.26 
 
 
651 aa  237  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.01 
 
 
592 aa  237  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.51 
 
 
584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  32.31 
 
 
660 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  33.89 
 
 
636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  32.21 
 
 
676 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.69 
 
 
587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.2 
 
 
594 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.39 
 
 
663 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.85 
 
 
605 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.53 
 
 
652 aa  234  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.85 
 
 
605 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.48 
 
 
664 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  32.03 
 
 
588 aa  233  6e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.86 
 
 
617 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.21 
 
 
617 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.29 
 
 
576 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.96 
 
 
663 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.35 
 
 
632 aa  232  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  33.49 
 
 
616 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.88 
 
 
600 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.76 
 
 
598 aa  230  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  28.67 
 
 
590 aa  229  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.78 
 
 
583 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  29.39 
 
 
590 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  33.42 
 
 
598 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.15 
 
 
582 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  37.54 
 
 
565 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.07 
 
 
655 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.23 
 
 
660 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.05 
 
 
587 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.75 
 
 
588 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  35.58 
 
 
553 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  35.58 
 
 
572 aa  227  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.69 
 
 
581 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.58 
 
 
592 aa  226  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.53 
 
 
544 aa  226  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  33.7 
 
 
625 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.06 
 
 
675 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35.21 
 
 
564 aa  226  9e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.71 
 
 
651 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  35.95 
 
 
603 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  34.87 
 
 
677 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.81 
 
 
652 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  35.92 
 
 
574 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.87 
 
 
694 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  34.87 
 
 
677 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.86 
 
 
582 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  38.01 
 
 
578 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  33.78 
 
 
638 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.44 
 
 
581 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.86 
 
 
582 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  35.7 
 
 
603 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.16 
 
 
596 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.86 
 
 
582 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  34.6 
 
 
559 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>