More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1344 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  99.29 
 
 		 565 aa  1126    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  100 
 
 		 565 aa  1135    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  42.5 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  39.96 
 
 		 530 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  31.05 
 
 		 579 aa  279  8e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.27 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.81 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.62 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.81 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.18 
 
 		 600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.99 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  38.44 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.82 
 
 		 599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.91 
 
 		 588 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.65 
 
 		 598 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.6 
 
 		 598 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.81 
 
 		 601 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  38.27 
 
 		 577 aa  246  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.89 
 
 		 599 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  34.3 
 
 		 583 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  37.33 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 604 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  34.55 
 
 		 619 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.75 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  30.85 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.44 
 
 		 611 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.77 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  32.46 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.27 
 
 		 571 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.48 
 
 		 614 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35 
 
 		 614 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.49 
 
 		 617 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  33.89 
 
 		 636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.2 
 
 		 594 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.01 
 
 		 592 aa  234  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  31.65 
 
 		 660 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  36.71 
 
 		 651 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.39 
 
 		 663 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.48 
 
 		 664 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  32.05 
 
 		 676 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.39 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.29 
 
 		 576 aa  232  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.85 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.24 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.85 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.01 
 
 		 652 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  32.78 
 
 		 616 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.88 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.34 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.75 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.5 
 
 		 663 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.71 
 
 		 588 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.15 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.76 
 
 		 598 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  33.08 
 
 		 598 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.78 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.07 
 
 		 655 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.95 
 
 		 588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35.77 
 
 		 564 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  34.87 
 
 		 677 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  33.7 
 
 		 625 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  34.87 
 
 		 677 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.33 
 
 		 675 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.08 
 
 		 585 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  37.54 
 
 		 565 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  35.77 
 
 		 574 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.23 
 
 		 660 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  28.87 
 
 		 590 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  28.14 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  35.31 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  35.31 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.71 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  34.43 
 
 		 659 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  34.6 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.95 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  38.58 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  33.78 
 
 		 638 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.83 
 
 		 646 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.83 
 
 		 646 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.17 
 
 		 544 aa  223  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  33.95 
 
 		 577 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  33 
 
 		 645 aa  223  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.72 
 
 		 652 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  35.95 
 
 		 603 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.56 
 
 		 694 aa  223  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  38.2 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  32.25 
 
 		 677 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.16 
 
 		 596 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.88 
 
 		 593 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  28.55 
 
 		 626 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.72 
 
 		 613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  33.72 
 
 		 578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  34.18 
 
 		 677 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  35.7 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>