More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0761 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0314  DNA primase  78.57 
 
 
604 aa  994    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  100 
 
 
588 aa  1204    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  41.62 
 
 
582 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  34.27 
 
 
669 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  34.85 
 
 
666 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  34.93 
 
 
678 aa  270  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  35.82 
 
 
625 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  34.36 
 
 
639 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  34.15 
 
 
655 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  33.73 
 
 
671 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  34.15 
 
 
681 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  29.17 
 
 
633 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  34.4 
 
 
623 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  32.81 
 
 
629 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  34.2 
 
 
639 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  31.32 
 
 
620 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  34.86 
 
 
680 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  33.57 
 
 
629 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  32.85 
 
 
627 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  31.75 
 
 
641 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  30.84 
 
 
683 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  31.52 
 
 
641 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  35.78 
 
 
671 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  33.02 
 
 
621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  35.9 
 
 
669 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  33.01 
 
 
642 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  31.97 
 
 
647 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  31.99 
 
 
633 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  33.17 
 
 
665 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  32.87 
 
 
656 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  34.2 
 
 
685 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  27.7 
 
 
646 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  31.84 
 
 
634 aa  247  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  35.91 
 
 
571 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  28.78 
 
 
646 aa  244  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  31.47 
 
 
641 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  34.99 
 
 
660 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.55 
 
 
660 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35 
 
 
617 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.46 
 
 
660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  35.18 
 
 
577 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.68 
 
 
660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  35.21 
 
 
572 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  35.21 
 
 
553 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  35.18 
 
 
578 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.13 
 
 
599 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.43 
 
 
600 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  32.56 
 
 
539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  32.08 
 
 
646 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  34.41 
 
 
579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  32.93 
 
 
669 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  33.25 
 
 
575 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.3 
 
 
601 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  32.9 
 
 
550 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  34.22 
 
 
656 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  36.03 
 
 
559 aa  231  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.96 
 
 
663 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  32.99 
 
 
575 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.53 
 
 
574 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.08 
 
 
595 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.42 
 
 
652 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  33.5 
 
 
573 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  31.74 
 
 
613 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  31.91 
 
 
676 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  34.27 
 
 
574 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.58 
 
 
645 aa  228  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.15 
 
 
651 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  34.57 
 
 
666 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  30.99 
 
 
654 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.87 
 
 
664 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.42 
 
 
663 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  34.27 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  34.27 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  30.51 
 
 
643 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  33.69 
 
 
660 aa  227  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.15 
 
 
638 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.74 
 
 
601 aa  226  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  30.68 
 
 
619 aa  226  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  40.45 
 
 
577 aa  226  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  34.16 
 
 
587 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  32.9 
 
 
581 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.5 
 
 
574 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  30.27 
 
 
643 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  34.33 
 
 
618 aa  226  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.42 
 
 
655 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  32.64 
 
 
576 aa  225  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  34.25 
 
 
579 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  30.53 
 
 
582 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.59 
 
 
601 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2708  DNA primase  27.14 
 
 
549 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  30.98 
 
 
581 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  32.98 
 
 
582 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  32.98 
 
 
582 aa  224  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  32.98 
 
 
582 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.5 
 
 
595 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>