More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2708 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2708  DNA primase  100 
 
 		 549 aa  1106    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  41.65 
 
 		 629 aa  350  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  41.33 
 
 		 629 aa  337  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  40.3 
 
 		 641 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  40.11 
 
 		 641 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  41.54 
 
 		 627 aa  329  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  39.62 
 
 		 639 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  40.33 
 
 		 642 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  38.98 
 
 		 647 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  37.97 
 
 		 633 aa  319  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  43.47 
 
 		 665 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  37.9 
 
 		 639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  36.86 
 
 		 671 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  43.1 
 
 		 680 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  36.7 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  37.9 
 
 		 655 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  37.15 
 
 		 681 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  36.73 
 
 		 669 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  41.81 
 
 		 625 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  37 
 
 		 666 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  36.48 
 
 		 656 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  42.51 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  41.79 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  40.84 
 
 		 678 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  38.6 
 
 		 594 aa  289  9e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  40.65 
 
 		 671 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  38.77 
 
 		 620 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  38.74 
 
 		 623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  39.72 
 
 		 641 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  41.26 
 
 		 683 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  38.08 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  40.74 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  38.85 
 
 		 621 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  41.53 
 
 		 613 aa  279  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.64 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  40.46 
 
 		 619 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  38.52 
 
 		 646 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  40.62 
 
 		 643 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  38.16 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  40.62 
 
 		 643 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  38.16 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.92 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  38.16 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  41.2 
 
 		 654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.58 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.68 
 
 		 581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.46 
 
 		 655 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.21 
 
 		 676 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.55 
 
 		 645 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.68 
 
 		 584 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  40.33 
 
 		 669 aa  273  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.1 
 
 		 664 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.86 
 
 		 660 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  38.16 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  37.2 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  41.4 
 
 		 646 aa  270  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.03 
 
 		 585 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.95 
 
 		 652 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  41.77 
 
 		 606 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.16 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.69 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  37.69 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.71 
 
 		 660 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.69 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.69 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.69 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.39 
 
 		 660 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  40.1 
 
 		 622 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  40.1 
 
 		 622 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.2 
 
 		 660 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.69 
 
 		 651 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  30.99 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  40.35 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  40.3 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  40.3 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  39.51 
 
 		 583 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.55 
 
 		 660 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  39.56 
 
 		 630 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.46 
 
 		 638 aa  264  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  38.44 
 
 		 574 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  40.3 
 
 		 800 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.98 
 
 		 586 aa  263  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  42.36 
 
 		 624 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  38.69 
 
 		 592 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  34.53 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  35.43 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>