More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0961 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  100 
 
 		 579 aa  1172    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  34.12 
 
 		 633 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  33.01 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  34.69 
 
 		 633 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  35.58 
 
 		 665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  33.87 
 
 		 627 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  30.98 
 
 		 582 aa  253  6e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  34.28 
 
 		 582 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  31.49 
 
 		 625 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.04 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.04 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.04 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.84 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  34.71 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  34.41 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.49 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  34.3 
 
 		 680 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  31.61 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  37.16 
 
 		 642 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  35.38 
 
 		 639 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  35.27 
 
 		 671 aa  243  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  33.81 
 
 		 584 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  28.5 
 
 		 646 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  33.72 
 
 		 623 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  34.83 
 
 		 678 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  34.54 
 
 		 629 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  33.19 
 
 		 647 aa  240  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.1 
 
 		 584 aa  240  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  36.73 
 
 		 577 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  36.67 
 
 		 641 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  36.48 
 
 		 578 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  32.42 
 
 		 584 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.83 
 
 		 614 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  34.92 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  33.12 
 
 		 666 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  34.84 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  36.43 
 
 		 641 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  34.61 
 
 		 669 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.26 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.54 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  34.24 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  34.19 
 
 		 655 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  33.18 
 
 		 685 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.55 
 
 		 581 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  35.55 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  34.17 
 
 		 669 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.55 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  35.06 
 
 		 601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.24 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.55 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  34.19 
 
 		 681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.55 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.03 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  34.24 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  34.42 
 
 		 656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  34.24 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  35.88 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0314  DNA primase  34.05 
 
 		 604 aa  234  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  32.62 
 
 		 683 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  33.89 
 
 		 671 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  33.75 
 
 		 574 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  27.36 
 
 		 645 aa  233  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  27.84 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  32.53 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.31 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  32.78 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  31.14 
 
 		 621 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.14 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  29.98 
 
 		 643 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.25 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.11 
 
 		 655 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  32.54 
 
 		 669 aa  231  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  34.99 
 
 		 575 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.25 
 
 		 574 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.88 
 
 		 573 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  35.42 
 
 		 553 aa  230  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  31.51 
 
 		 654 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.73 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  36.51 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  35.42 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  33.5 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  33 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.7 
 
 		 651 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  33.08 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.1 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.19 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  34.86 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.31 
 
 		 617 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  35.18 
 
 		 609 aa  227  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.73 
 
 		 660 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.29 
 
 		 660 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.47 
 
 		 660 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.44 
 
 		 652 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>