More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0806 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  100 
 
 		 639 aa  1309    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  46.7 
 
 		 582 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  45.99 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  46.23 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  45.99 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  45.75 
 
 		 581 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  45.75 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  45.75 
 
 		 582 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  45.75 
 
 		 582 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  45.05 
 
 		 584 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  45.75 
 
 		 582 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  45.52 
 
 		 581 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  40.59 
 
 		 663 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  45.43 
 
 		 660 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.84 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  45.43 
 
 		 660 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  42.94 
 
 		 663 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.38 
 
 		 651 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  42.73 
 
 		 588 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.13 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  45 
 
 		 664 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  45.95 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  45.02 
 
 		 576 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  43.8 
 
 		 638 aa  364  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  46.65 
 
 		 666 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  42.92 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  44.3 
 
 		 655 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  43.76 
 
 		 577 aa  359  8e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  41.86 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  42.65 
 
 		 656 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  42.06 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  42.39 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  46.56 
 
 		 631 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  42.92 
 
 		 617 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.59 
 
 		 645 aa  352  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  42.96 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  42.93 
 
 		 576 aa  352  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  42.11 
 
 		 579 aa  351  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  38.5 
 
 		 571 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  42.51 
 
 		 577 aa  349  8e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  42.27 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  42.15 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  42.39 
 
 		 575 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  42.12 
 
 		 573 aa  345  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  41.77 
 
 		 584 aa  345  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  43.3 
 
 		 574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  42.82 
 
 		 574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  43.06 
 
 		 574 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  43.3 
 
 		 574 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  45.13 
 
 		 613 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  43.29 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  41.18 
 
 		 575 aa  339  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  42.58 
 
 		 574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  42.11 
 
 		 574 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  37.2 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  36 
 
 		 621 aa  337  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  42.58 
 
 		 574 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  41.78 
 
 		 553 aa  336  7.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  42.34 
 
 		 574 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  42.58 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  41.78 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  39.38 
 
 		 585 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  42.35 
 
 		 601 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  43.06 
 
 		 576 aa  334  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  40.05 
 
 		 595 aa  333  5e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  42.42 
 
 		 676 aa  333  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  43.5 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  42.58 
 
 		 583 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  35.54 
 
 		 652 aa  332  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  43.06 
 
 		 629 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  40.76 
 
 		 641 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  42.18 
 
 		 660 aa  329  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  42.03 
 
 		 598 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  36.9 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  40.53 
 
 		 641 aa  327  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  41.67 
 
 		 669 aa  327  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  40.49 
 
 		 583 aa  326  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  41.97 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  37.45 
 
 		 647 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  41.79 
 
 		 642 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  43.86 
 
 		 565 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  36.32 
 
 		 680 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  35.81 
 
 		 639 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  45.37 
 
 		 603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  45.37 
 
 		 603 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  35.28 
 
 		 666 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  39.76 
 
 		 588 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  34.15 
 
 		 665 aa  318  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>