70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0981 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  94.99 
 
 		 380 aa  730    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  35.89 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  34.3 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6607  putative DNA primase  31.63 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1631  hypothetical protein  32.51 
 
 		 280 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.21 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32.18 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  36 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  30.57 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  36.54 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  31.95 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  32.68 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  36.73 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  34.72 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  35.57 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  30.92 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  36.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  31.78 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  34.02 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  32.73 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  34.23 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  35.44 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  35.17 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  33.79 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  34.93 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  29.62 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  29.89 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  29.89 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  34.44 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  34.51 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  31.16 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  26.67 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  34.67 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  26.69 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  28.77 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.51 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.51 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  32.39 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  29.86 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  28.23 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  27.38 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  33.52 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  25.92 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  31.72 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  30.97 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  30.15 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  35.66 
 
 		 588 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  27.65 
 
 		 899 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  31.01 
 
 		 646 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  29.75 
 
 		 588 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  29.59 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  27.38 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  26.5 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  27 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  29.7 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  39.02 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.68 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  25.69 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  33.55 
 
 		 655 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  28.85 
 
 		 669 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  36.25 
 
 		 776 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  30.71 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  27.81 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  25.91 
 
 		 572 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>