284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1121 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  33.7 
 
 		 738 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  31.93 
 
 		 701 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  33.51 
 
 		 732 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  32.2 
 
 		 590 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  45.45 
 
 		 437 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  32.33 
 
 		 868 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  32.33 
 
 		 868 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  32.33 
 
 		 868 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  32.68 
 
 		 815 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  30.57 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.18 
 
 		 880 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  27.8 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.77 
 
 		 578 aa  65.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  40 
 
 		 655 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  36.92 
 
 		 756 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  29.78 
 
 		 731 aa  62.4  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  29.49 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  39.22 
 
 		 682 aa  58.9  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  34.88 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  36.23 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  35.56 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  29.41 
 
 		 834 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  33.72 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  35.96 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  29.29 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  33.01 
 
 		 601 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.51 
 
 		 582 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.51 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  35.37 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  34.09 
 
 		 578 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.7 
 
 		 720 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  34.78 
 
 		 624 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  32.18 
 
 		 571 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  30.16 
 
 		 629 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  32.18 
 
 		 600 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.18 
 
 		 598 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  23.13 
 
 		 673 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  24.82 
 
 		 579 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  28.87 
 
 		 623 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  31.82 
 
 		 614 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  33.33 
 
 		 642 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.93 
 
 		 712 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  27.93 
 
 		 712 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  35.29 
 
 		 634 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  25.37 
 
 		 613 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  31.82 
 
 		 653 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  26.67 
 
 		 599 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.93 
 
 		 712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  28.38 
 
 		 712 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  22.54 
 
 		 660 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  32.14 
 
 		 598 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  30.68 
 
 		 641 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  28.57 
 
 		 699 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  29.21 
 
 		 648 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  35.48 
 
 		 573 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  33 
 
 		 601 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  31.91 
 
 		 645 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.95 
 
 		 600 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  31.88 
 
 		 651 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.72 
 
 		 613 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  28.04 
 
 		 596 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  33.7 
 
 		 655 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  26.89 
 
 		 574 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  32 
 
 		 576 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  32.41 
 
 		 574 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  31.87 
 
 		 616 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  31.03 
 
 		 639 aa  52.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.04 
 
 		 760 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  32.41 
 
 		 574 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  27.05 
 
 		 577 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.71 
 
 		 619 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  28.92 
 
 		 567 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  27.05 
 
 		 577 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  28.74 
 
 		 565 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  28.74 
 
 		 565 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  31.07 
 
 		 618 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  28.42 
 
 		 656 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  36.84 
 
 		 629 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  27.59 
 
 		 595 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  36.51 
 
 		 572 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.6 
 
 		 583 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  31.11 
 
 		 645 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.71 
 
 		 595 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  31.48 
 
 		 574 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  28.97 
 
 		 617 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  31.3 
 
 		 629 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  26.17 
 
 		 599 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>