67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0727 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1822  putative DNA primase  37.38 
 
 		 574 aa  350  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  40.51 
 
 		 930 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  37.5 
 
 		 841 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  26.45 
 
 		 739 aa  101  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1629  hypothetical protein  26.9 
 
 		 624 aa  98.6  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  36.3 
 
 		 979 aa  89  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  41.44 
 
 		 890 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  41.44 
 
 		 890 aa  85.5  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  41.6 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 716 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  39.05 
 
 		 368 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  40.78 
 
 		 899 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 712 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  37.82 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  40 
 
 		 838 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  30.2 
 
 		 834 aa  78.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  41.49 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.21 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  40.21 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  40 
 
 		 895 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  44.71 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 273 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  31.39 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.96 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  31.39 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  32.09 
 
 		 712 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  32.09 
 
 		 712 aa  75.5  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  32.09 
 
 		 712 aa  75.5  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  38.78 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  32.09 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  36.63 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  40.66 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  40.66 
 
 		 777 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  40.66 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  41.76 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  35.71 
 
 		 760 aa  72  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 929 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  37.23 
 
 		 878 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  40.66 
 
 		 777 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  30.08 
 
 		 845 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  31.78 
 
 		 765 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  67.4  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  29.24 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  30.77 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.26 
 
 		 731 aa  63.9  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  36.84 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  39 
 
 		 355 aa  62  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  34 
 
 		 775 aa  62  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  34.48 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.83 
 
 		 866 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  32.97 
 
 		 775 aa  60.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.14 
 
 		 682 aa  60.8  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  38.04 
 
 		 371 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  37.31 
 
 		 338 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  33.63 
 
 		 892 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 361 aa  55.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 575 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.85 
 
 		 358 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.85 
 
 		 358 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  30.77 
 
 		 355 aa  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  29.22 
 
 		 437 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  25.75 
 
 		 1026 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  25.75 
 
 		 1026 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>