50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0886 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  100 
 
 		 868 aa  1815    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  100 
 
 		 868 aa  1815    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  100 
 
 		 868 aa  1815    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  43.94 
 
 		 867 aa  767    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  47.89 
 
 		 397 aa  335  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  30.6 
 
 		 647 aa  241  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.55 
 
 		 1002 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.53 
 
 		 1006 aa  229  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  38.29 
 
 		 815 aa  165  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  42.25 
 
 		 590 aa  159  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.51 
 
 		 732 aa  146  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  32.95 
 
 		 701 aa  131  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.02 
 
 		 725 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  35.87 
 
 		 718 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.02 
 
 		 880 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  31.3 
 
 		 738 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  29.5 
 
 		 437 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  32.33 
 
 		 277 aa  91.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  25 
 
 		 1776 aa  90.5  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  27.73 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  38.64 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  70.5  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2708  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1038 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00403632  hitchhiker  0.00987423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  42.17 
 
 		 127 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  24.88 
 
 		 895 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  53.57 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  41.79 
 
 		 141 aa  61.6  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  51.79 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  42.86 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  41.79 
 
 		 798 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1050 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  26.24 
 
 		 605 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  24.69 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  26.24 
 
 		 605 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  26.24 
 
 		 614 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  29.41 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  42.19 
 
 		 759 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  42.86 
 
 		 283 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  54.05 
 
 		 696 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  34.62 
 
 		 595 aa  47.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  48.78 
 
 		 293 aa  47.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  25.45 
 
 		 606 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  40.38 
 
 		 684 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  21.91 
 
 		 654 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  27.5 
 
 		 639 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  43.1 
 
 		 609 aa  44.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  30.67 
 
 		 673 aa  44.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  24.84 
 
 		 350 aa  44.3  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  27.48 
 
 		 535 aa  44.3  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>