69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1480 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  67.65 
 
 		 354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  64.23 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  61.03 
 
 		 351 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  60.29 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  62.18 
 
 		 353 aa  315  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  63.74 
 
 		 353 aa  314  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  60.07 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  62.64 
 
 		 353 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  60.36 
 
 		 348 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  59.71 
 
 		 344 aa  301  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  59.71 
 
 		 344 aa  301  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  61.9 
 
 		 351 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  57.51 
 
 		 346 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  58.24 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  61.03 
 
 		 346 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  59.56 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  59.71 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  58.97 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  58.03 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  56.57 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  55.84 
 
 		 347 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  55.68 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  49.82 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  55.31 
 
 		 346 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  51.81 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  52.21 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  49.09 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  52 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  51.62 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  45.36 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  43.62 
 
 		 352 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  42.75 
 
 		 348 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  45.13 
 
 		 357 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  33.99 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  32.14 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.68 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  26.7 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  29.71 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  34.01 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  30.77 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2197  Exonuclease III-like protein  61.54 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.51 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  34.5 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.96 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  28.57 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  31.47 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  34.98 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  29.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2655  hypothetical protein  33.51 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.89 
 
 		 1986 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1955 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  27.88 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.86 
 
 		 1986 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.49 
 
 		 1986 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.49 
 
 		 1986 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  34.23 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.49 
 
 		 1986 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  27.1 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.49 
 
 		 1986 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  24.3 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  27.81 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  25.56 
 
 		 401 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  28.67 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>